30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2617 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2617  CsbD family protein  100 
 
 		 98 aa  186  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  63.27 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  41.84 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  38.78 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  51.85 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  50 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  45.61 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  60.87 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  44.44 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  48.28 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  42.42 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  42.11 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  33.33 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  45.61 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  43.1 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  45.31 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  47.17 
 
 		 56 aa  43.5  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  45.1 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  41.07 
 
 		 56 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  39.29 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  43.18 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  50 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  38.6 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  43.1 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  39.66 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  46.81 
 
 		 63 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>