More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1381 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1381  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3981  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.71 
 
 
257 aa  359  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3826  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  68.78 
 
 
260 aa  331  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2352  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  71.79 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0605839  normal  0.0748288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4683  enoyl-CoA hydratase  68.03 
 
 
252 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5068  enoyl-CoA hydratase  68.03 
 
 
252 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4769  enoyl-CoA hydratase  68.03 
 
 
252 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0532353  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4618  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  67.09 
 
 
263 aa  321  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13583  enoyl-CoA hydratase  66.4 
 
 
247 aa  318  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5266  enoyl-CoA hydratase  66.39 
 
 
251 aa  317  7.999999999999999e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2065  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  69.2 
 
 
255 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.702116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1490  enoyl-CoA hydratase  66.8 
 
 
251 aa  315  4e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2743  enoyl-CoA hydratase  68.02 
 
 
259 aa  308  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2803  enoyl-CoA hydratase  61.97 
 
 
248 aa  298  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.72856  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2604  enoyl-CoA hydratase  60.26 
 
 
271 aa  288  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888828  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1562  enoyl-CoA hydratase  47.46 
 
 
258 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1436  enoyl-CoA hydratase  45.96 
 
 
269 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185731  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2158  enoyl-CoA hydratase  44.68 
 
 
261 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3755  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.28 
 
 
251 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3627  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.87 
 
 
214 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270403  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.66 
 
 
267 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 
257 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181739  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5498  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1532  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.383816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3752  enoyl-CoA hydratase  32.34 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1562  enoyl-CoA hydratase  32.42 
 
 
254 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.649225  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5876  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6159  enoyl-CoA hydratase  34.58 
 
 
258 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  35.41 
 
 
270 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3489  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
264 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  33.64 
 
 
261 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1966  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
264 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489089  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3446  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
264 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4289  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
290 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4077  enoyl-CoA hydratase  36.15 
 
 
290 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  33.18 
 
 
261 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1717  enoyl-CoA hydratase  31.67 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.45767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1171  enoyl-CoA hydratase  34.91 
 
 
266 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277406  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3974  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  0.377725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  32.09 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  32.09 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  32.09 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.92 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  32.09 
 
 
261 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  32.09 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.48 
 
 
260 aa  99  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.03 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3413  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.56 
 
 
256 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.19 
 
 
260 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  32.39 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.13 
 
 
261 aa  95.9  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4505  enoyl-CoA hydratase  35.55 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289171  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  30.63 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10764  enoyl-CoA hydratase (AFU_orthologue; AFUA_2G10650)  31.02 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2283  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
261 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.39 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  32.71 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.22 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.17 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3816  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
261 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.276208  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  34.42 
 
 
266 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0960  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0584352  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1436  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.47 
 
 
275 aa  94  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342669  normal  0.157988 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1046  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 
261 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3997  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
272 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3884  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
272 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192414  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  29.36 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  27.23 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0328  naphthoate synthase  36.41 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0113118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.23 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2475  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.45 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.932872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.45 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  31.16 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  32.14 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  32.6 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  29.87 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  33.19 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3101  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.34 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429404  hitchhiker  0.000105979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3284  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.45 
 
 
257 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34821  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 
261 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 
297 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  29.77 
 
 
297 aa  92  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.77 
 
 
261 aa  92  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  27.88 
 
 
257 aa  92  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  29.77 
 
 
261 aa  92  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2111  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.33 
 
 
265 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0534343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  28.94 
 
 
280 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2967  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.6 
 
 
266 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00963503  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1319  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.49 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1719  naphthoate synthase  35.92 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  32.09 
 
 
657 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  28.45 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.2 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>