More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0806 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
471 aa  934    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  64.16 
 
 
479 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  64.78 
 
 
465 aa  544  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  58.97 
 
 
493 aa  519  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  61.07 
 
 
463 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  63.17 
 
 
495 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  61.78 
 
 
460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  62.72 
 
 
491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  61.26 
 
 
471 aa  512  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.19 
 
 
464 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  61 
 
 
478 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  61.21 
 
 
468 aa  502  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  58.51 
 
 
491 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  60.34 
 
 
483 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  59.96 
 
 
506 aa  499  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  56.99 
 
 
468 aa  497  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  59.57 
 
 
481 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  60.87 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  57.56 
 
 
476 aa  493  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  62.96 
 
 
480 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  61.49 
 
 
478 aa  492  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  57.36 
 
 
470 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  57.08 
 
 
467 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  58.85 
 
 
467 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  58.77 
 
 
463 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  56.28 
 
 
463 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  56.57 
 
 
467 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  56.01 
 
 
467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  54.55 
 
 
467 aa  458  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  54.56 
 
 
495 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  55.41 
 
 
471 aa  458  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  54.39 
 
 
470 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  53.5 
 
 
471 aa  451  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  54.39 
 
 
470 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  54.18 
 
 
470 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  54.03 
 
 
467 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.12 
 
 
470 aa  256  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.93 
 
 
459 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
562 aa  238  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
458 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.5 
 
 
465 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.1 
 
 
465 aa  230  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
448 aa  229  7e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.83 
 
 
465 aa  228  1e-58  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
459 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
459 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
468 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.07 
 
 
459 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.03 
 
 
462 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.74 
 
 
466 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
467 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
463 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
472 aa  224  4e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3945  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  35.84 
 
 
481 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.332023  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.57 
 
 
459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 
465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 
458 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.47 
 
 
471 aa  222  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
585 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.87 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.79 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.97 
 
 
469 aa  220  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
457 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.8 
 
 
468 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.8 
 
 
468 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.29 
 
 
465 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
464 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 
459 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 
469 aa  218  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
474 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 
471 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.65 
 
 
470 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  30.39 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 
465 aa  218  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.97 
 
 
471 aa  217  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 
616 aa  217  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.09 
 
 
470 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
465 aa  216  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.37 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.82 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.42 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.41 
 
 
481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.18 
 
 
459 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.72 
 
 
461 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  29.25 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 
484 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
484 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.61 
 
 
464 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.6 
 
 
466 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>