25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0397 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0397  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 475 aa  919    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264481  normal  0.0251152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  39.68 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  28.72 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  28.54 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  30.6 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5720  hypothetical protein  28.19 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 432 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 362 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.28 
 
 		 1180 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 		 979 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 909 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  27.27 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 1050 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.46 
 
 		 603 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 685 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 183 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 637 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 686 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0258  sulfotransferase  39.47 
 
 		 626 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.27 
 
 		 1040 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 76 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>