More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3669 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.69 
 
 		 162 aa  203  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.47 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.41 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  55.31 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.67 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.76 
 
 		 178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.27 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.19 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  55 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  59.48 
 
 		 164 aa  191  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  55 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.17 
 
 		 174 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  52.94 
 
 		 222 aa  191  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  56.86 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  55 
 
 		 200 aa  189  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  55 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.69 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  59.86 
 
 		 158 aa  187  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  53.9 
 
 		 172 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  53.9 
 
 		 172 aa  187  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  56.69 
 
 		 182 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.99 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.29 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  53.25 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  53.25 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.05 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.87 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  53.29 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  53.29 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  53.25 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  53.29 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  53.29 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  53.29 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  55 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  53.29 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  53.29 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.06 
 
 		 164 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.27 
 
 		 168 aa  184  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  53.12 
 
 		 168 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.41 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  53.85 
 
 		 169 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  52.63 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.7 
 
 		 163 aa  181  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  52.94 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.05 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  53.06 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  52.94 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  52.6 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.69 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.69 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.33 
 
 		 152 aa  168  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.67 
 
 		 152 aa  168  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  49.1 
 
 		 168 aa  167  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  51.37 
 
 		 155 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  50.32 
 
 		 170 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  51.37 
 
 		 152 aa  164  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  48.15 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 154 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  48.63 
 
 		 148 aa  164  9e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  48.63 
 
 		 148 aa  164  9e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  51.7 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  52.74 
 
 		 146 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  49.04 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.52 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.62 
 
 		 166 aa  161  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  48.47 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.02 
 
 		 475 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  47.06 
 
 		 183 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.68 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.44 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.95 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.32 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 137 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.02 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1349  hypothetical protein  52.38 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.36 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.51 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  48.03 
 
 		 165 aa  154  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.03 
 
 		 165 aa  154  8e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  51.79 
 
 		 182 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.65 
 
 		 484 aa  154  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.95 
 
 		 148 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.75 
 
 		 361 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  49.36 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.33 
 
 		 461 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.58 
 
 		 231 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.75 
 
 		 361 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  53.38 
 
 		 149 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  47.5 
 
 		 166 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  46.67 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1956  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.06 
 
 		 193 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.31 
 
 		 156 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  47.68 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  53.38 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.09 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  49.32 
 
 		 161 aa  151  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.3 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.25 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  48.95 
 
 		 150 aa  150  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>