64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2671 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2671  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 68 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0762  4-oxalocrotonate tautomerase  83.08 
 
 		 69 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0732  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  69.12 
 
 		 68 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0970  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  66.18 
 
 		 76 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.926455  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1550  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  62.69 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45080  4-oxalocrotonate tautomerase  64.18 
 
 		 71 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.16237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4749  4-oxalocrotonate tautomerase  62.69 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1135  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  64.18 
 
 		 68 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1584  4-oxalocrotonate tautomerase  65.15 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0595401  normal  0.151595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4060  4-oxalocrotonate tautomerase  64.06 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4071  4-oxalocrotonate tautomerase  64.06 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0102  4-oxalocrotonate tautomerase  64.06 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1969  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.46 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1640  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  61.19 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00039965  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2365  4-oxalocrotonate tautomerase  54.41 
 
 		 68 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.710003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0011  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  60 
 
 		 67 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0360  4-oxalocrotonate tautomerase  61.54 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000450156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3415  4-oxalocrotonate tautomerase  59.7 
 
 		 74 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4074  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  58.46 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3224  hypothetical protein  53.03 
 
 		 71 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0310  4-oxalocrotonate tautomerase  63.08 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0321  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  63.08 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0332  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  63.08 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192785  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3903  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2051  4-oxalocrotonate tautomerase  58.21 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2301  4-oxalocrotonate tautomerase  58.21 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0855  4-oxalocrotonate tautomerase  55.22 
 
 		 67 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3098  4-oxalocrotonate tautomerase  60 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.268479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2281  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 68 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.680097  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2575  4-oxalocrotonate tautomerase  53.97 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.773055  normal  0.0111474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4577  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  55.38 
 
 		 72 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0985205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2346  4-oxalocrotonate tautomerase  53.73 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3995  4-oxalocrotonate tautomerase  53.85 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3281  4-oxalocrotonate tautomerase  48.61 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.324694  normal  0.650212 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0469  hypothetical protein  48.53 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0159737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1271  hypothetical protein  48.53 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0377038  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1455  hypothetical protein  46.38 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.134745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  49.23 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0818  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.24 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2504  4-oxalocrotonate tautomerase  45.45 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0078  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  46.15 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5684  4-oxalocrotonate tautomerase  45.07 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0576297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1472  hypothetical protein  41.43 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6827  4-oxalocrotonate tautomerase  43.84 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3914  4-oxalocrotonate tautomerase  41.1 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7095  4-oxalocrotonate tautomerase  43.06 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4145  4-oxalocrotonate tautomerase  41.67 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.711569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0200  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  43.55 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0857  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0300  4-oxalocrotonate tautomerase  37.1 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.483341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2113  hypothetical protein  37.31 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.867892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  34.38 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0859  hypothetical protein  29.85 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1270  4-oxalocrotonate tautomerase  32.73 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  38.18 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1900  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 63 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1320  4-oxalocrotonate tautomerase  30.88 
 
 		 132 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.11875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2370  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949058  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4665  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1308  4-oxalocrotonate tautomerase  30.88 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0297  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  27.94 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.1 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0319  4-oxalocrotonate tautomerase family protein  29.23 
 
 		 68 aa  40  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>