84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1673 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  45.05 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  38.75 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  35.71 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  36.26 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  33.7 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  37.04 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  36.11 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  36.56 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0823  hypothetical protein  34.18 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.636113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  37.18 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  29.35 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1347  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5111  hypothetical protein  26.09 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  30.11 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  30.11 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  30.11 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  35.48 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  35.48 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  35.8 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  29.21 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  35.29 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  38.55 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  29.63 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  27.16 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0105  hypothetical protein  36.11 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.771179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  31.46 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  27.16 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  29.27 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  31.18 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  30.34 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  29.55 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  32.88 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  32 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3717  hypothetical protein  35.62 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  34.15 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  32.1 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  27.17 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3777  hypothetical protein  35.62 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3704  hypothetical protein  35.62 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0724  hypothetical protein  36.71 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  29.21 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0603  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  30.11 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  28.26 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4178  hypothetical protein  35.62 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0483142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  35.96 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  28.41 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  35.23 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  29.63 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  37.88 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  33.8 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  28.75 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  28.4 
 
 		 96 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0727  hypothetical protein  34.48 
 
 		 98 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  28.09 
 
 		 95 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0734  hypothetical protein  27.17 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129876 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  28.26 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0720  hypothetical protein  27.17 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  30.43 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  32.1 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0714  hypothetical protein  27.17 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168478  normal  0.457903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34.92 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  34.25 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2475  hypothetical protein  34.25 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.901733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  34.18 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  34.18 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  34.09 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  34.09 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  34.92 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  30.95 
 
 		 95 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  29.27 
 
 		 97 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  32.93 
 
 		 106 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>