48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0940 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0940  major facilitator family transporter  100 
 
 		 398 aa  791    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0662  major facilitator transporter  72.31 
 
 		 391 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0524  major facilitator family transporter  71.39 
 
 		 388 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3168  major facilitator transporter  68.46 
 
 		 390 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3285  major facilitator transporter  71.54 
 
 		 391 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3461  major facilitator transporter  71.54 
 
 		 391 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1006  hypothetical protein  33.05 
 
 		 136 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0814  transporter protein, putative  24.36 
 
 		 475 aa  54.3  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3982  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 413 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  24.78 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 433 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1437  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.483807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1829  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0142  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 511 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.52 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 446 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0407  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  36.76 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  24.42 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  32.35 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2370  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.7 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52000  MFS family transporter: hexose  23.86 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128216  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  25.29 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  32.35 
 
 		 477 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.35 
 
 		 477 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.05141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 449 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  23.24 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  37 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  27.22 
 
 		 480 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  37 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 458 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02614  plasma membrane hexose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00220)  24.14 
 
 		 528 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.969205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  32.63 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  28.57 
 
 		 493 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 436 aa  42.7  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>