30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2614 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2614  putative lipoprotein  100 
 
 		 184 aa  357  5e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2931  putative lipoprotein  97.83 
 
 		 184 aa  331  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1491  Lipoprotein LpqB, GerMN domain protein  31.01 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0516  spore germination protein-like  34.58 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0346133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2723  hypothetical protein  33.59 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15500  hypothetical protein  28.9 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.308262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2543  spore germination protein-like protein  33.33 
 
 		 465 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000191345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1229  spore germination protein-like protein  33.33 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0403693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0441  hypothetical protein  30.99 
 
 		 484 aa  61.6  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000131637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4407  hypothetical protein  27.81 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0362  cytochrome b5  29.17 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.063504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0276  hypothetical protein  30.34 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0748556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1084  cytochrome b5  34.57 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.194541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1954  hypothetical protein  32.14 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.508711  normal  0.643926 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2506  spore germination protein-like  28.3 
 
 		 328 aa  54.7  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0523043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0447  putative germination protein GerM  24.32 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1942  hypothetical protein  25.81 
 
 		 299 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.141052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4218  spore germination protein-like protein  37.35 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000199131  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1550  hypothetical protein  26.96 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403206  hitchhiker  0.00759922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1052  spore germination protein-like protein  31.73 
 
 		 288 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2479  spore germination protein-like protein  26.42 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2736  hypothetical protein  24.26 
 
 		 165 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000414813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0261  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2081  hypothetical protein  31.46 
 
 		 306 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1351  hypothetical protein  31.76 
 
 		 397 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.033419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07940  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.82 
 
 		 383 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0187  hypothetical protein  28.09 
 
 		 390 aa  47  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00032944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4041  hypothetical protein  27.27 
 
 		 596 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1956  hypothetical protein  25.25 
 
 		 309 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.173181  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0518  hypothetical protein  39.71 
 
 		 248 aa  41.2  0.007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>