More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0437 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  100 
 
 		 287 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  98.95 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  58.21 
 
 		 290 aa  348  9e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  54.64 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  53.93 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 290 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 290 aa  328  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 290 aa  328  8e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  53.93 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  53.93 
 
 		 290 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  53.93 
 
 		 290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  53.93 
 
 		 290 aa  326  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  52.65 
 
 		 288 aa  324  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  52.61 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 		 290 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  51.92 
 
 		 290 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  53.71 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  52.26 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  52.26 
 
 		 290 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  46.32 
 
 		 286 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 288 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  44.48 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  44.48 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2023  ABC transporter related  43.86 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1990  ABC transporter related  43.86 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2276  ABC transporter related  47.9 
 
 		 282 aa  235  7e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  42.05 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  42.31 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  40.28 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3904  ABC transporter related  40.89 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0282216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  40.45 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0117  ABC transporter related  38.11 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000514692  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2508  ABC transporter related  45.09 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2649  ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0192  ABC transporter related  40.62 
 
 		 288 aa  185  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  36.53 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3651  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.058748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3662  ABC transporter ATP-binding protein  40.59 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862592  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  32.49 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  32.49 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  32.49 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  31.77 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  31.77 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  31.41 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  42.08 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  30.26 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  31.41 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0066  ABC transporter related  31.56 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  31.41 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  31.41 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0409  ABC transporter related  36.73 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00250472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0399  ABC transporter related  36.73 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00135528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  31.72 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  32 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  30.04 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  32.73 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  29.39 
 
 		 289 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0963  ABC transporter related  37.86 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.63233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  32.11 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  33.33 
 
 		 306 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  37.44 
 
 		 313 aa  145  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  37.38 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  38.83 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  30.58 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  38.28 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  32.34 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.41 
 
 		 302 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.27 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.29 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  36.54 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  34.42 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  30.43 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  38.46 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  39.32 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  37.8 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.43 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1355  ABC transporter related  36 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.91 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  36.23 
 
 		 293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2776  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 360 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  32.37 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  34.53 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  30.88 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  27.35 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>