More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05610 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05610  essential conserved GTPase, putative  100 
 
 
525 aa  1050    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00889  GTP-binding protein Obg (AFU_orthologue; AFUA_1G15500)  37.12 
 
 
555 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.634559  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42651  Mitochondrial GTPase 2  28.07 
 
 
488 aa  149  8e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  33.88 
 
 
435 aa  150  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  33.55 
 
 
435 aa  147  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  33.23 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  33.23 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  34.04 
 
 
362 aa  137  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  35.19 
 
 
372 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  34.04 
 
 
370 aa  136  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  35.51 
 
 
397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  35.19 
 
 
372 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  35.19 
 
 
372 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  35.19 
 
 
372 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  35.19 
 
 
372 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  35.19 
 
 
372 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  35.19 
 
 
372 aa  135  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.25 
 
 
348 aa  133  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  36.48 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  32.63 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.45 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  35.45 
 
 
370 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.25 
 
 
425 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  34.15 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  32.49 
 
 
352 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.82 
 
 
426 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  35.14 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  35.66 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  33.96 
 
 
370 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  27.04 
 
 
440 aa  129  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.45 
 
 
438 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  28.82 
 
 
327 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  34.9 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.73 
 
 
437 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  30.85 
 
 
346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  34.21 
 
 
343 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.84 
 
 
396 aa  127  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  29.65 
 
 
364 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  37.34 
 
 
422 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  33.21 
 
 
365 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  34.81 
 
 
373 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  33.83 
 
 
365 aa  126  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  34.78 
 
 
357 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  34.48 
 
 
433 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  30.72 
 
 
363 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.17 
 
 
350 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.17 
 
 
429 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  29.42 
 
 
361 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  32.92 
 
 
357 aa  125  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  34.67 
 
 
370 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.06 
 
 
463 aa  125  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.71 
 
 
434 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  31.27 
 
 
329 aa  125  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.02 
 
 
415 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.04 
 
 
340 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  34.42 
 
 
373 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  32.92 
 
 
357 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  29.41 
 
 
424 aa  124  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.86 
 
 
359 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.09 
 
 
369 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  32.27 
 
 
349 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.78 
 
 
371 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  34.42 
 
 
379 aa  124  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  35.23 
 
 
353 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  33.21 
 
 
364 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  33.21 
 
 
364 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  35.66 
 
 
400 aa  123  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  33.92 
 
 
344 aa  123  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  35.71 
 
 
405 aa  123  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  29.12 
 
 
368 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  32.08 
 
 
353 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  37.16 
 
 
343 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  31.16 
 
 
354 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  31.33 
 
 
395 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.01 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  31.4 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  34.18 
 
 
346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  35.17 
 
 
405 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  31.4 
 
 
329 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  31.45 
 
 
353 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.64 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  30.13 
 
 
434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  32.03 
 
 
424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  34.44 
 
 
362 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  34.84 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  31.4 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1240  GTPase ObgE  31.65 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.155825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.51 
 
 
426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  32.84 
 
 
366 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  28.99 
 
 
358 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  31.91 
 
 
353 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  32.48 
 
 
350 aa  120  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  32.65 
 
 
406 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.85 
 
 
374 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.85 
 
 
374 aa  120  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  31.15 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  34.2 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0220  GTPase ObgE  29.43 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0532  GTPase ObgE  29.41 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0114887  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0317  GTPase ObgE  28.27 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>