29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00740 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI00740  hypothetical protein  100 
 
 
670 aa  1345    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.309758  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00409  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04960)  36.6 
 
 
807 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000909963  normal  0.437099 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52710  predicted protein  27.92 
 
 
682 aa  76.6  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  37.84 
 
 
1370 aa  67.4  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.96 
 
 
1107 aa  58.9  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  28.24 
 
 
1015 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  30.28 
 
 
1744 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  30.28 
 
 
448 aa  51.6  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  28.79 
 
 
384 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  26.16 
 
 
1351 aa  50.8  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  26.89 
 
 
1749 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.14 
 
 
482 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  35.04 
 
 
1481 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  28.32 
 
 
867 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  32.35 
 
 
713 aa  47  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.93 
 
 
863 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  30.77 
 
 
1481 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  34.29 
 
 
508 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.4 
 
 
307 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27807  predicted protein  31.4 
 
 
770 aa  45.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.555868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.91 
 
 
1263 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  36.25 
 
 
2324 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  32.18 
 
 
355 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  34.48 
 
 
766 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  30.12 
 
 
204 aa  44.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  29.09 
 
 
937 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  28.92 
 
 
1052 aa  44.3  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  28.91 
 
 
1041 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  29.09 
 
 
937 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>