250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG04050 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01133  Putative uncharacterized protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74710]  42.61 
 
 
270 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.234786  normal  0.0831451 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84906  predicted protein  48.5 
 
 
252 aa  204  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.521244  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1506  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0005 domain protein)  33.89 
 
 
233 aa  98.6  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.874501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0287  hypothetical protein  35.21 
 
 
231 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0234  hypothetical protein  34.74 
 
 
231 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0261  hypothetical protein  35.21 
 
 
231 aa  95.9  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1784  hypothetical protein  33.18 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0337  putative ferric receptor CfrA  33.96 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.284951  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2115  ribonuclease 3 (ribonuclease III) (RNase III)  33.19 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  28.76 
 
 
234 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1782  hypothetical protein  34.94 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104064  normal  0.0481152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  26.52 
 
 
245 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  31.49 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2270  protein of unknown function UPF0005  42.86 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  35.71 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  31.51 
 
 
235 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  31.06 
 
 
235 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  35.71 
 
 
242 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1764  hypothetical protein  31.82 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1441  protein of unknown function UPF0005  31.82 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0811132  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1268  integral membrane protein, interacts with FtsH  28.98 
 
 
240 aa  79  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.01414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  38.1 
 
 
256 aa  79  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  30.05 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  28 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  29.38 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  31.1 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  28.38 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0971  hypothetical protein  32.2 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000502235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  34.46 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1973  hypothetical protein  33.75 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  0.569668 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0111  hypothetical protein  32.1 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.485373  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2003  hypothetical protein  33.75 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.026814  hitchhiker  0.000326951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2060  hypothetical protein  33.75 
 
 
219 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00317153  hitchhiker  0.0000338815 
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  26.41 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  27.19 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  30.36 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  25.76 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  29.73 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  30.28 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  26.41 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  31.02 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  28.26 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2001  hypothetical protein  31.25 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000304908  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  32.56 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  28.94 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  33.81 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  33.61 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2375  hypothetical protein  32.5 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  25 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  31.28 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2313  hypothetical protein  30.63 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000688522  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  32.67 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2201  protein of unknown function UPF0005  30.63 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000806989  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2205  hypothetical protein  30.63 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  35.2 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0363  hypothetical protein  28.71 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000375584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2166  hypothetical protein  30.63 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169017  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  33.57 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  26.79 
 
 
232 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  35.37 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0272  membrane protein  26.81 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000292393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4993  hypothetical protein  34.44 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1809  hypothetical protein  31.29 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000169879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2014  hypothetical protein  33.52 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000147608  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  29.77 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  32.8 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  28.14 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  29.77 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  32.77 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  29.77 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  28.87 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3472  hypothetical protein  26.61 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.31473  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2111  hypothetical protein  31.33 
 
 
220 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000565103  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  28.24 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  27.7 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3782  protein of unknown function UPF0005  31.37 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1804  hypothetical protein  30.43 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.372462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  25.1 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1882  integral membrane protein  28.37 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.302191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0308  hypothetical protein  28.37 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  27.36 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2136  hypothetical protein  29.19 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0452556  normal  0.017863 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  28.81 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0466  protein of unknown function UPF0005  28.44 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  31.06 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  27.73 
 
 
235 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  29.95 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  29.1 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  30.51 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>