31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00540 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1025 aa  2066    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  36.36 
 
 
831 aa  106  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  35.42 
 
 
616 aa  55.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  36.21 
 
 
531 aa  55.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  43.4 
 
 
411 aa  55.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  35.9 
 
 
637 aa  54.7  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  42.86 
 
 
397 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  41.18 
 
 
812 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  33.33 
 
 
537 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  50.82 
 
 
235 aa  52.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  36.73 
 
 
559 aa  52  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  38.78 
 
 
403 aa  51.6  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  38.64 
 
 
417 aa  51.6  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  38 
 
 
551 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34003  predicted protein  33.33 
 
 
450 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29935  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  45.65 
 
 
317 aa  50.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  35.56 
 
 
238 aa  49.7  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_24789  Predicted E3 ubiquitin ligase  34.78 
 
 
468 aa  49.7  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  32.08 
 
 
91 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  40 
 
 
295 aa  48.5  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  39.22 
 
 
334 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  38.98 
 
 
82 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  32.39 
 
 
439 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  40.91 
 
 
231 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  36.84 
 
 
1348 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  38.46 
 
 
376 aa  46.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  36.54 
 
 
127 aa  46.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86664  ubiquitin-protein ligase Anaphase Promoting Complex  36.99 
 
 
136 aa  45.8  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  33.33 
 
 
442 aa  45.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  38 
 
 
437 aa  45.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  39.13 
 
 
632 aa  45.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>