15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86664 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86664  ubiquitin-protein ligase Anaphase Promoting Complex  100 
 
 		 136 aa  289  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10394  anaphase promoting complex subunit Apc11, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01380)  50 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.136684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  48.94 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_9831  predicted protein  42.11 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04200  ubiquitin-protein ligase, putative  39.81 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.267821  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  36.99 
 
 		 1025 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39090  predicted protein  26.47 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08844  RING-box protein 1 (Broad)  26.37 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.43925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37145  Skp1 Cullin-F-box ubiquitin protein ligase (SCF) subunit  26.32 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03140  ubiquitin-protein ligase, putative  27.63 
 
 		 142 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0134629  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54486  ferric reductase 1  28.57 
 
 		 1326 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43986  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_14301  predicted protein  31.25 
 
 		 1518 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45472  predicted protein  32.56 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.369869  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  35.14 
 
 		 341 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 534 aa  40.4  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>