41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0304 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  99.15 
 
 		 249 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  97.46 
 
 		 249 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  52.77 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  46.15 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  45.65 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  40.71 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  41.2 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 		 253 aa  158  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 		 295 aa  52.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  36.92 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  25.25 
 
 		 357 aa  49.7  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 		 274 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 292 aa  46.2  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 359 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 276 aa  45.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 333 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  30.68 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  45 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 276 aa  42.4  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  42.5 
 
 		 369 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 315 aa  41.6  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>