65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1604 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 493 aa  1002    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  28.08 
 
 		 548 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  28.65 
 
 		 529 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  23.56 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  25.84 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  23.29 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  24.47 
 
 		 324 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  24.64 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  23.08 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  25.22 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  26.37 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  23.61 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  24.28 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.47 
 
 		 403 aa  57  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  22.88 
 
 		 331 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  23.81 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  23.36 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  24.68 
 
 		 325 aa  54.3  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  25.47 
 
 		 404 aa  53.5  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.93 
 
 		 325 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  25 
 
 		 241 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  24.49 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  20.87 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  22.13 
 
 		 331 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  21.83 
 
 		 397 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  20.59 
 
 		 336 aa  52.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  23.53 
 
 		 345 aa  51.6  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  21.33 
 
 		 504 aa  50.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  24.24 
 
 		 388 aa  50.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  22.22 
 
 		 393 aa  50.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  22.78 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  21.86 
 
 		 400 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  24.9 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  20.85 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.73 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  21.58 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  25.59 
 
 		 253 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  29.55 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  23.29 
 
 		 325 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  23.08 
 
 		 384 aa  47  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  40.35 
 
 		 238 aa  47  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  25.19 
 
 		 383 aa  47  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.9 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.7 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  20.08 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  20.73 
 
 		 246 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  20.35 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0782  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.24 
 
 		 304 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0840  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  21.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.331684  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  22.41 
 
 		 341 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  20.09 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  31.94 
 
 		 232 aa  44.7  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.5 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2710  Nucleotidyl transferase  21.91 
 
 		 322 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  21.28 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  22.08 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  22.22 
 
 		 325 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  22.46 
 
 		 399 aa  43.9  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  24.47 
 
 		 245 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  20 
 
 		 353 aa  43.5  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.61 
 
 		 400 aa  43.5  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  25.32 
 
 		 240 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3830  Nucleotidyl transferase  23.32 
 
 		 327 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.108201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>