54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0358 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0358  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  695    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1652  hypothetical protein  97.44 
 
 		 352 aa  681    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000404268  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0335  hypothetical protein  98.86 
 
 		 352 aa  689    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  53.52 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1587  tRNA-I(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  46.89 
 
 		 354 aa  333  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1664  methionyl-tRNA formyltransferase  48.3 
 
 		 356 aa  332  6e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0272  permease YjgP/YjgQ  46.46 
 
 		 353 aa  315  6e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.720647  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1302  permease YjgP/YjgQ  41.93 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0213  permease YjgP/YjgQ family protein  38.35 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.763286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0467  permease YjgP/YjgQ  36.18 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  22.67 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.42 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  21.01 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  21.32 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  19.85 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 		 352 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  20.06 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  19.85 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  19.13 
 
 		 353 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  21 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  31.43 
 
 		 339 aa  49.7  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.13 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  21.25 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  19.12 
 
 		 352 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  23.13 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  22.5 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  22.5 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  22.5 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  22.5 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  22.5 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  17.89 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  20.07 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  20.66 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  22.08 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  22.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  22.15 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>