42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0326 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
249 aa  500  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  98.39 
 
 
249 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  99.15 
 
 
236 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  54.03 
 
 
246 aa  277  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  46.56 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  45.11 
 
 
239 aa  211  9e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 
234 aa  205  5e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 
248 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  41.15 
 
 
248 aa  195  5.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  34.3 
 
 
253 aa  162  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  36.92 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  25.25 
 
 
357 aa  48.5  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 
338 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 
274 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
359 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 
285 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 
256 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  21.21 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 
448 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 
286 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  45 
 
 
369 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  35.59 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 
286 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 
276 aa  42.7  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
281 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  42.5 
 
 
369 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 
273 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  23.42 
 
 
288 aa  42  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>