More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3685 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  100 
 
 		 152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  53.46 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  48.68 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  46.71 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  47.65 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  46.05 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 167 aa  141  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  43.87 
 
 		 151 aa  140  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  46.11 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  44.52 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  44.74 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  45.03 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  44.08 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  56.64 
 
 		 175 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  45.22 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  54.78 
 
 		 178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  46.76 
 
 		 238 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  55.86 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  49.6 
 
 		 222 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  43.79 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  49.61 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 167 aa  133  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  52.14 
 
 		 214 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  44.52 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.68 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  42.68 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  53.27 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  59.43 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  49.61 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 187 aa  131  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  53.98 
 
 		 188 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  56.19 
 
 		 200 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  55.36 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  50.89 
 
 		 231 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  49.23 
 
 		 190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  43.6 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  44.38 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  42.24 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  50.43 
 
 		 161 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  45.39 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 236 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 234 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  48.84 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 234 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 234 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  43.11 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  53.27 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  52.07 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  44.59 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  43.02 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  52.34 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  53.98 
 
 		 181 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  55.05 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  56.19 
 
 		 196 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 182 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  42.68 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 185 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  52.34 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 186 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  51.3 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  43.87 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 196 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 199 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 192 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 192 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  44.81 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  43.51 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.36 
 
 		 163 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  55.96 
 
 		 181 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  55.45 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  55.45 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  55.45 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  55.45 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  55.45 
 
 		 176 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 184 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 187 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 177 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  44.3 
 
 		 154 aa  126  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 179 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  54.63 
 
 		 181 aa  126  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 236 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>