More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1827 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 92 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  73.91 
 
 		 92 aa  143  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  75.56 
 
 		 98 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  75.56 
 
 		 98 aa  140  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  70.65 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  72.53 
 
 		 93 aa  136  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  71.91 
 
 		 91 aa  133  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  68.54 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  65.17 
 
 		 89 aa  124  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  54.64 
 
 		 98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0244  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  54.64 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  54.08 
 
 		 100 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  56.67 
 
 		 103 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  52.58 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  50.52 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  49.46 
 
 		 97 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  53.19 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  52.17 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 101 aa  100  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 96 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 100 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 		 98 aa  99.4  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 95 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  53.26 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 		 94 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  47.96 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 		 101 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>