225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0308 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0308  a-glucan phosphorylase  100 
 
 
544 aa  1136    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2105  alpha-glucan phosphorylase  56.64 
 
 
550 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.669842  normal  0.393403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3228  alpha-glucan phosphorylase  53.02 
 
 
549 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0235  alpha-glucan phosphorylase  51.2 
 
 
554 aa  579  1e-164  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.400789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3551  alpha-glucan phosphorylase  51.3 
 
 
567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.266998 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0370  alpha-glucan phosphorylase  48.4 
 
 
520 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0535  alpha-glucan phosphorylase  47.26 
 
 
520 aa  488  1e-136  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0467  alpha-glucan phosphorylase  48.59 
 
 
520 aa  487  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1452  alpha-glucan phosphorylase  48.02 
 
 
520 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0980  alpha-glucan phosphorylase  46.42 
 
 
519 aa  462  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.490785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1209  alpha-glucan phosphorylase  40.04 
 
 
541 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000841932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21480  Alpha-glucan phosphorylase  36.35 
 
 
535 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08630  alpha-glucan phosphorylase  38.04 
 
 
545 aa  354  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2576  alpha-glucan phosphorylase  37.15 
 
 
540 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000251576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19350  alpha-glucan phosphorylase  37 
 
 
541 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1647  alpha-glucan phosphorylase  34.84 
 
 
823 aa  320  5e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0594  alpha-glucan phosphorylases  34.15 
 
 
703 aa  317  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2051  alpha-glucan phosphorylase  34.41 
 
 
736 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.010282  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1084  Alpha-glucan phosphorylase  33.76 
 
 
737 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1871  alpha-glucan phosphorylase  33.55 
 
 
855 aa  310  4e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.168119  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1581  alpha-glucan phosphorylase  34.28 
 
 
844 aa  307  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3322  alpha-glucan phosphorylase  35.07 
 
 
854 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1595  Alpha-glucan phosphorylase  33.11 
 
 
706 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.419211 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0371  carbohydrate phosphorylase family protein  32.19 
 
 
854 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0615  alpha-glucan phosphorylase  32.13 
 
 
703 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.326054 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0554  alpha-glucan phosphorylase  32.57 
 
 
704 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.449309  normal  0.434341 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2362  alpha-glucan phosphorylase  33.01 
 
 
848 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4181  alpha-glucan phosphorylase  31.61 
 
 
719 aa  294  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239535  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0273  alpha-glucan phosphorylase  34.09 
 
 
850 aa  292  8e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1262  alpha-glucan phosphorylases  32.95 
 
 
748 aa  293  8e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.458843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1364  alpha-glucan phosphorylase  33.83 
 
 
849 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1771  alpha-glucan phosphorylase  31.95 
 
 
849 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.848129  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0443  alpha-glucan phosphorylase  34.47 
 
 
847 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1784  Alpha-glucan phosphorylase  32.46 
 
 
705 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0722  alpha-glucan phosphorylase  32.62 
 
 
706 aa  291  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.949223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0897  alpha-glucan phosphorylase  31.45 
 
 
722 aa  290  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0878  alpha-glucan phosphorylase  34.35 
 
 
690 aa  289  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3159  Alpha-glucan phosphorylase  32.73 
 
 
854 aa  288  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1198  Alpha-glucan phosphorylase  32.62 
 
 
842 aa  288  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.681343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2872  alpha-glucan phosphorylase  30.68 
 
 
716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3820  alpha-glucan phosphorylase  30.96 
 
 
850 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1001  alpha-glucan phosphorylase  32.43 
 
 
838 aa  287  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3904  alpha-glucan phosphorylase  31.42 
 
 
850 aa  286  5e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0004418 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0357  alpha-glucan phosphorylases  33.06 
 
 
855 aa  286  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1148  alpha-glucan phosphorylase  32.79 
 
 
712 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1338  alpha-glucan phosphorylase  31.8 
 
 
871 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.624148  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4193  alpha-glucan phosphorylase  31.86 
 
 
854 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2117  alpha-glucan phosphorylase  32.29 
 
 
832 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0946  alpha-glucan phosphorylase  31.91 
 
 
853 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0301  Alpha-glucan phosphorylase  32.04 
 
 
693 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1526  alpha-glucan phosphorylase  31.94 
 
 
719 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0465155  normal  0.559814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3493  alpha-glucan phosphorylase  31.86 
 
 
713 aa  280  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2215  alpha-glucan phosphorylase  32.28 
 
 
853 aa  280  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0582  Alpha-glucan phosphorylase  31.82 
 
 
856 aa  279  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1720  alpha-glucan phosphorylase  32.34 
 
 
854 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0849  alpha-glucan phosphorylase  31.8 
 
 
850 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2996  Alpha-glucan phosphorylase  32.95 
 
 
854 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.852006  normal  0.45421 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1852  Alpha-glucan phosphorylase  31.48 
 
 
854 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1198  alpha-glucan phosphorylases  33.69 
 
 
538 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1731  glucan phosphorylase  31.63 
 
 
570 aa  272  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126462  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10370  alpha-glucan phosphorylase  31.16 
 
 
855 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2345  alpha-glucan phosphorylase  30.81 
 
 
877 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148077  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4099  alpha-glucan phosphorylase  30.6 
 
 
849 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3890  alpha-glucan phosphorylases  32.4 
 
 
563 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721527  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1810  alpha-glucan phosphorylase  30.58 
 
 
694 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2874  alpha-glucan phosphorylase  31.6 
 
 
862 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2857  alpha-glucan phosphorylase  29.95 
 
 
863 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1476  alpha-glucan phosphorylase  31.59 
 
 
841 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581638  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1799  alpha-glucan phosphorylase family protein  31.59 
 
 
841 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3895  Alpha-glucan phosphorylase  31.16 
 
 
713 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2169  alpha-glucan phosphorylase  32.3 
 
 
858 aa  267  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0860  alpha-glucan phosphorylase  29.84 
 
 
875 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3415  alpha-glucan phosphorylases  31.42 
 
 
854 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  29.85 
 
 
1421 aa  265  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0621  alpha-glucan phosphorylase  30.88 
 
 
858 aa  265  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6071  alpha-glucan phosphorylase  30.98 
 
 
835 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.456754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8139  Phosphorylase  28.69 
 
 
860 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3090  alpha-glucan phosphorylase  29.52 
 
 
857 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00460109  hitchhiker  0.00000313954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1069  alpha-glucan phosphorylase  29.67 
 
 
854 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.909638  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28480  alpha-glucan phosphorylase  29.59 
 
 
851 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347339  normal  0.510878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3064  alpha-glucan phosphorylase  31.89 
 
 
822 aa  264  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11360  glycogen phosphorylase glgP  29.76 
 
 
863 aa  263  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.236917 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1399  alpha-glucan phosphorylases  29.79 
 
 
717 aa  263  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4300  alpha-glucan phosphorylases  30.42 
 
 
881 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.989256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3845  alpha-glucan phosphorylases  30.13 
 
 
860 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0264557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0534  hypothetical protein  31.29 
 
 
567 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1298  alpha-glucan phosphorylase  30.11 
 
 
858 aa  261  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.431468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2234  alpha-glucan phosphorylases  30.11 
 
 
561 aa  260  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3859  Alpha-glucan phosphorylase  29.97 
 
 
860 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3933  alpha-glucan phosphorylases  29.97 
 
 
860 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.856517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2480  alpha-glucan phosphorylases  32.74 
 
 
737 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0543  alpha-glucan phosphorylase  32.92 
 
 
578 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3582  alpha-glucan phosphorylase  28.46 
 
 
863 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0956  alpha-glucan phosphorylases  31.31 
 
 
852 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.631272  normal  0.360082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0586  alpha-glucan phosphorylase  29.58 
 
 
873 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.923216  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0736  alpha-glucan phosphorylases  30.16 
 
 
872 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1109  alpha-glucan phosphorylases  31.26 
 
 
851 aa  257  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.407099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1424  Alpha-glucan phosphorylase  31.71 
 
 
854 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2460  alpha-glucan phosphorylase  29.48 
 
 
849 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11500  alpha-glucan phosphorylase  29.46 
 
 
853 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.896855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>