More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1653 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1653  peptide ABC transporter, permease protein  100 
 
 
316 aa  616  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.644278  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1449  peptide ABC transporter, permease protein  41.94 
 
 
316 aa  251  9.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000218444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1001  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 
316 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
316 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00583871  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1754  peptide ABC transporter, permease protein  40.32 
 
 
314 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0569132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0823  oligopeptide ABC transporter, permease  35.56 
 
 
316 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4385  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.02052e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0946  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1934  peptide ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0997  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.28482e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0808  oligopeptide ABC transporter, permease  34.6 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1568  peptide ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0859  oligopeptide ABC transporter permease  34.92 
 
 
316 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0909  oligopeptide ABC transporter permease protein  34.92 
 
 
316 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0836804  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
321 aa  187  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2117  dipeptidase  36.97 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.92 
 
 
340 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
340 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1869  ABC-type transport system protein  32 
 
 
324 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32 
 
 
333 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
321 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.17 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
313 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.637959  normal  0.0297418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1766  peptide ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 
321 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.147265  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
329 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.487916  normal  0.350225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.35 
 
 
338 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
323 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.66 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.75386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.63 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
324 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0425  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.366309  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4562  dipeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0171  hypothetical protein  32.33 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
321 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0692911 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
322 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.3137  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58440  ABC transporter permease  32.8 
 
 
336 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.514083  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.259028  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
321 aa  172  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.793124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 
326 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.21 
 
 
336 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
328 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
313 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  32.36 
 
 
313 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
325 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1620  peptide ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
321 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.911317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4610  oligopeptide ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
306 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
315 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
323 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181861  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4392  oligopeptide ABC transporter permease  37.12 
 
 
306 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4233  oligopeptide transport, system permease  37.12 
 
 
306 aa  169  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4245  oligopeptide ABC transporter, permease  37.12 
 
 
306 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4732  oligopeptide ABC transporter permease protein  37.12 
 
 
306 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
313 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  33.44 
 
 
336 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0812  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.43 
 
 
336 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153061  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
313 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.12 
 
 
336 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  33.44 
 
 
336 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
328 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0188  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 
325 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  30.6 
 
 
339 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  30.6 
 
 
339 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  30.6 
 
 
339 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  30.6 
 
 
339 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  33.12 
 
 
336 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
307 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373349  normal  0.751724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
313 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  30.6 
 
 
339 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  30.28 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  30.6 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
333 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
319 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.11 
 
 
306 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  29.97 
 
 
339 aa  166  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7182  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  34.62 
 
 
329 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7557  putative dipeptide ABC transporter (permease protein)  31.9 
 
 
323 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0785  peptide ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.334762  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000183272  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0736  peptide ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
328 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
320 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  30.6 
 
 
351 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
320 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  30.28 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  30.28 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  30.28 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  30.28 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  30.28 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  30.28 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  30.28 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  30.28 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>