28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0284 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  100 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  38.46 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  39.33 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  30.72 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  29.41 
 
 		 227 aa  62  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  30.46 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  27.36 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  23.88 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  35.56 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  34.34 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  25.17 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  26.52 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  28.23 
 
 		 220 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  22.47 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  27.13 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  26.21 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  26 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  30.09 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  32.89 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  25.58 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  24.81 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  26.32 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  32.86 
 
 		 316 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  37.04 
 
 		 244 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  24.19 
 
 		 277 aa  42  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  24.26 
 
 		 292 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>