60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1172 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1172  Dual specificity phosphatase catalytic subunit  100 
 
 
428 aa  862    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0267685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0008  dual specificity protein phosphatase  44 
 
 
445 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.851139  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5538  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  42.25 
 
 
451 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2698  hypothetical protein  42.93 
 
 
449 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4660  Dual specificity protein phosphatase  39.04 
 
 
449 aa  280  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3658  putative dual specificity phosphatase  41.58 
 
 
444 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31730  hypothetical protein  41.99 
 
 
437 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00205255  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  37.91 
 
 
439 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3002  PAP2 family phosphatase  37.68 
 
 
439 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3080  putative dual specificity phosphatase  37.68 
 
 
439 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4013  dual specificity protein phosphatase  38.7 
 
 
464 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2884  Dual specificity protein phosphatase  37.44 
 
 
437 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.170107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0894  dual specificity protein phosphatase  36 
 
 
471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1376  dual specificity protein phosphatase  36 
 
 
471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4521  dual specificity protein phosphatase  35.53 
 
 
468 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157527  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  35.42 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1354  dual specificity protein phosphatase  34.82 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302883  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1631  PAP2 family protein  35.56 
 
 
430 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1279  dual specificity protein phosphatase  35.7 
 
 
467 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594668  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1592  PAP2 family protein  35.32 
 
 
430 aa  222  9e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01366  predicted phosphatase, inner membrane protein  35.96 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01378  hypothetical protein  35.96 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2234  putative dual specificity phosphatase  36.05 
 
 
438 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1254  dual specificity protein phosphatase  35.29 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2014  PAP2 family protein  35.08 
 
 
430 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2877  putative phosphatase protein  36.41 
 
 
447 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510949  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2247  putative dual specificity phosphatase  37.16 
 
 
438 aa  219  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1494  PAP2 family protein  37.16 
 
 
430 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1761  PAP2 family protein  36.21 
 
 
430 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2781  membrane-associated phospholipid phosphatase  28.54 
 
 
478 aa  160  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000634589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02972  dual specificity phosphatase, catalytic domain protein  41.18 
 
 
132 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2741  hypothetical protein  33.64 
 
 
565 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2673  hypothetical protein  33.18 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2848  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4088  hypothetical protein  32.47 
 
 
540 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  28.76 
 
 
550 aa  67  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0255  hypothetical protein  30.43 
 
 
581 aa  66.2  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.353984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1411  hypothetical protein  29.15 
 
 
568 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1445  hypothetical protein  30.05 
 
 
563 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1419  hypothetical protein  29.15 
 
 
563 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1730  Dual specificity protein phosphatase  27.95 
 
 
246 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2935  hypothetical protein  30.05 
 
 
563 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6332  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1320  hypothetical protein  28.95 
 
 
560 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01681  hypothetical protein  28.79 
 
 
545 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.604942  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0242  hypothetical protein  28.8 
 
 
533 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.513795  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3710  hypothetical protein  30.48 
 
 
547 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001937  methylglyoxal synthase  28.1 
 
 
552 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.67 
 
 
202 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.73 
 
 
217 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1760  dual specificity protein phosphatase  28.75 
 
 
169 aa  47.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0708  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.56 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1413  hypothetical protein  30 
 
 
212 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1932  phosphatase  25.42 
 
 
222 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0283031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.54 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  27.89 
 
 
206 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  28.67 
 
 
486 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.65 
 
 
235 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2238  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.77 
 
 
242 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  30 
 
 
219 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.84 
 
 
238 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>