More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10273 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10273  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 399 aa  825    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.42 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499459  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1939  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  51.66 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1259  Alanine dehydrogenase  53.25 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4284  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  51.54 
 
 		 408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2439  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  51.85 
 
 		 382 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4962  Alanine dehydrogenase  47.55 
 
 		 408 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.699914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2994  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  46.25 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0579773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  46.13 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0767  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  43.12 
 
 		 403 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0875  L-alanine dehydrogenase  44.09 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0627  alanine dehydrogenase  42.23 
 
 		 411 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1878  alanine dehydrogenase  43.82 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2150  Alanine dehydrogenase  42.19 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.52 
 
 		 406 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1700  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.62 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000678625 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  37.43 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  37.43 
 
 		 372 aa  259  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  38.25 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  36.99 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  35.68 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  38.42 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  35.12 
 
 		 371 aa  243  6e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2068  alanine dehydrogenase  38.25 
 
 		 371 aa  242  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  40.06 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 370 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2630  alanine dehydrogenase  39.34 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0012805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4758  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4521  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.693738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4357  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4368  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.103175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4752  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000212885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4873  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1961  L-alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000331426  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2015  L-alanine dehydrogenase  37.53 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000641536  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2355  alanine dehydrogenase  36.24 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  37.16 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2325  alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000753672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  35.14 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  35.14 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4731  alanine dehydrogenase  34.86 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2048  L-alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000213241  hitchhiker  0.00195154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0630  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.936299  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1760  L-alanine dehydrogenase  37.36 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  34.32 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  34.59 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  35.14 
 
 		 377 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2154  alanine dehydrogenase  37.26 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000415402  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  36.44 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  37.19 
 
 		 371 aa  236  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1068  alanine dehydrogenase  35.36 
 
 		 371 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0663  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  35.18 
 
 		 367 aa  235  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0662308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  39.07 
 
 		 377 aa  235  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  36.07 
 
 		 373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  36.71 
 
 		 371 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  37.35 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  37.35 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2908  L-alanine dehydrogenase  38.4 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  36.99 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  36.71 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  35.15 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  36.71 
 
 		 372 aa  233  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  38.61 
 
 		 370 aa  233  6e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  36.16 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  36.16 
 
 		 371 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  36.34 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  37.03 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  37.4 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  37.03 
 
 		 370 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1930  alanine dehydrogenase  36.24 
 
 		 376 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.275818  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2235  alanine dehydrogenase  37.1 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000122217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  33.52 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1404  alanine dehydrogenase  37.9 
 
 		 370 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1557  alanine dehydrogenase  35.62 
 
 		 372 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  36.49 
 
 		 370 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  34.22 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  33.7 
 
 		 365 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  32.88 
 
 		 370 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  36.78 
 
 		 360 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2485  alanine dehydrogenase  36.56 
 
 		 371 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000102544  unclonable  0.0000000221603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4356  alanine dehydrogenase  34.14 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.80752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  35.11 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0909  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  37.07 
 
 		 363 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21130  alanine dehydrogenase  38.12 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  36.71 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  35.48 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  35.68 
 
 		 371 aa  222  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3804  alanine dehydrogenase  34.63 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3772  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  37.64 
 
 		 363 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal  0.386692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  35.46 
 
 		 366 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>