More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05775 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  100 
 
 		 104 aa  205  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 104 aa  126  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  66.67 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  55.56 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  58.42 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  56.31 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1896  50S ribosomal protein L24  54.08 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000004985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  53.06 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 105 aa  103  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  49.07 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2391  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000223185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3903  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000356583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0294  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000911949  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0594  50S ribosomal protein L24  56.44 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000014526  normal  0.407014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4354  ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000283369  normal  0.0433971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  53.85 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5776  ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 118 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0501804  normal  0.536525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 106 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  51.49 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4533  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114986  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  55.79 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03160  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000206027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0404  ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3796  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3694  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000331178  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3625  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00533524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3733  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.012207  normal  0.015742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0416  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000325696  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0404  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839278  hitchhiker  0.0000141467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3604  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000161475  normal  0.0245278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3740  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000337214  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3698  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000743122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3625  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000301612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4632  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000390519  normal  0.45352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03111  hypothetical protein  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000161136  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3503  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000502759  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3792  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256632  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 105 aa  94.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 101 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  53.93 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000125199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0334  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000849803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  45 
 
 		 110 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  45.54 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47.17 
 
 		 107 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  93.6  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  53.54 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 107 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 105 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3151  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.609062 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 		 107 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0061  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000762997  hitchhiker  1.34485e-17 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  91.3  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.06 
 
 		 105 aa  91.3  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  90.9  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  44.44 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  50.96 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000086996  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  47 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  43.43 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  50.98 
 
 		 101 aa  90.5  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>