More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1447 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
135 aa  270  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  68.18 
 
 
136 aa  179  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  69.05 
 
 
134 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  63.36 
 
 
132 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  63.36 
 
 
132 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  52.89 
 
 
127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  54.81 
 
 
118 aa  120  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  55.56 
 
 
109 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  47.41 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 
118 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  45.87 
 
 
118 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  46.79 
 
 
118 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  47.06 
 
 
118 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  46.46 
 
 
104 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.38 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  38.46 
 
 
107 aa  76.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  36.54 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  38.98 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.58 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  38.74 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  38.75 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  39.51 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.78 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  35.04 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  38.74 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1894  FeS assembly scaffold SufA  35.04 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.334137  hitchhiker  0.00505979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  36.36 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.14 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0616  putative FeS assembly scaffold SufA  32.46 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.25627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.36 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.62 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.75 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.62 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.36 
 
 
110 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  36.75 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  36.04 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.69 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  36.04 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  35.04 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  33.65 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.75 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.02 
 
 
206 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  35.59 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  33.65 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.65 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.04 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  32.48 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.45 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.38 
 
 
107 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.85 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  34.91 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.54 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  36.94 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3982  FeS assembly scaffold SufA  36.94 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  34.91 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  35.19 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  34.62 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  33.64 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.63 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.73 
 
 
116 aa  60.5  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.25 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.69 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.81 
 
 
113 aa  60.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40380  Iron-sulfur biogenesis protein  35.85 
 
 
107 aa  60.5  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.11 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.43 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1859  HesB/YadR/YfhF  32.69 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.9 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.9 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  28.85 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.85 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.77 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1631  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  31.13 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.017999  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.91 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  30.48 
 
 
206 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2988  HesB/YadR/YfhF  35.56 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0481576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.45 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.96 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.48 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  32.69 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.69 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.69 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.43 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.96 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.96 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.96 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.21 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2209  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.36 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.02 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  30.77 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.02 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  33.33 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.02 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>