More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1560 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
106 aa  215  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  61.32 
 
 
106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.81 
 
 
106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  59.05 
 
 
107 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  52.38 
 
 
106 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.38 
 
 
106 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  57.14 
 
 
106 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  54.29 
 
 
106 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
106 aa  120  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
106 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.38 
 
 
106 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  54.29 
 
 
106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
106 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  48.11 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  48.57 
 
 
107 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  49.06 
 
 
110 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
114 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.34 
 
 
116 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  45.87 
 
 
123 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
119 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  43.4 
 
 
127 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2266  HesB/YadR/YfhF family protein  45.19 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1741  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000381054  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1821  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00928185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2278  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  45.19 
 
 
107 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00670907  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
206 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  48.19 
 
 
123 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  91.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.4 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.58 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
118 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.93 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
120 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2147  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  90.5  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00101616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1295  HesB/YadR/YfhF family protein  43.27 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.609132  normal  0.0124228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  39.42 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  41.9 
 
 
110 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
115 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  44.86 
 
 
206 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1778  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  88.6  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000335505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2500  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  hitchhiker  0.00778132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1963  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00723814  hitchhiker  0.00183278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2395  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2384  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.35 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000545288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  42.31 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
107 aa  87  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  40.78 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0675  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004358  iron binding protein IscA for iron-sulfur cluster assembly  40.95 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.17 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0824  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  42.31 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0263078  normal  0.761008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1425  iron-binding protein IscA  40 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  37.14 
 
 
116 aa  85.5  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.78 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1106  iron-sulfur cluster assembly protein  41.9 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0886041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.91 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1239  HesB/YadR/YfhF:Iron-sulphur cluster assembly protein IscA  40 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.78 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2494  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.25 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.686511  normal  0.176727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.85 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.81 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4334  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  41.9 
 
 
107 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0987592  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  36.54 
 
 
128 aa  84.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  41.35 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
125 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0250  HesB/YadR/YfhF family protein  40 
 
 
107 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1760  iron-sulfur cluster assembly scaffold protein  39.42 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000228802 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2101  FeS assembly scaffold SufA  35.58 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  36.79 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  36.79 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  36.79 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
117 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3082  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.68 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0030958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  36.79 
 
 
117 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3064  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.68 
 
 
119 aa  84  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  36.79 
 
 
117 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2260  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.510827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  36.79 
 
 
117 aa  84  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.1 
 
 
113 aa  84  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2445  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.1 
 
 
107 aa  84.3  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.300922  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  36.79 
 
 
117 aa  84  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
118 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
119 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>