More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1406 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_1406  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
134 aa  270  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  69.05 
 
 
135 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  56.35 
 
 
136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  53.33 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  51.61 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  51.61 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3644  HesB/YadR/YfhF-family protein  51.4 
 
 
118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4470  HesB/YadR/YfhF  50.98 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5902  putative iron-sulfur cluster assembly protein  54.64 
 
 
109 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.316321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0113  HesB/YadR/YfhF-family protein  50.52 
 
 
104 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1065  HesB/YadR/YfhF  48.65 
 
 
118 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5109  HesB/YadR/YfhF-family protein  47.27 
 
 
118 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  47.22 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0398  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
118 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.770041  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  44.66 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1531  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.182474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1247  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.86 
 
 
114 aa  76.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  35.92 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  39.81 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.94 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.05 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.85 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  37.04 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.85 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.04 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  37.04 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3609  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.25 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.518848  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  38.32 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.91 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.91 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  37.25 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3325  FeS assembly scaffold SufA  37.04 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  35.19 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.74 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.17 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4331  FeS assembly scaffold SufA  35.19 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.95 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  34.95 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  38.32 
 
 
206 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0939  HesB/YadR/YfhF family protein  39.05 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.665013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0934  hesb protein  39.05 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.92 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.98 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.19 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.96 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.93 
 
 
206 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  34.55 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  33.98 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.55 
 
 
106 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.98 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  33.98 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2134  hypothetical protein  35.85 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.191156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  35.19 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.85 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.432369  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1491  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  38.1 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2442  FeS assembly scaffold SufA  36.36 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.434123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.58 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  32.08 
 
 
119 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  41.18 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  37.27 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  37.27 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  37.27 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0471  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  39.62 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0506099  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.36 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.46 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.38 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  37.27 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.96 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1291  HesB/YadR/YfhF  29.73 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0112575  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.41 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.41 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1776  FeS assembly scaffold SufA  35.24 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.641899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  32.41 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.02 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1793  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.33 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.872961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.48 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2247  FeS assembly scaffold SufA  37.78 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0453155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4462  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.26 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0997  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.19 
 
 
125 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147129  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.08 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.01 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.5 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.48 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3356  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.29 
 
 
109 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0224722  normal  0.165998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  38.1 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.69 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4351  FeS assembly scaffold SufA  34.26 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.48 
 
 
123 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  33.33 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>