More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1227 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
122 aa  244  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
122 aa  244  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.24 
 
 
106 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.82 
 
 
121 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1581  HesB/YadR/YfhF  52.38 
 
 
186 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617469  normal  0.0534413 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  50.48 
 
 
106 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.55 
 
 
119 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.55 
 
 
119 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  49.11 
 
 
123 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.49 
 
 
127 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  49.52 
 
 
106 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.49 
 
 
127 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.48 
 
 
106 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  49.51 
 
 
127 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
105 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  49.52 
 
 
107 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.66 
 
 
107 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  50 
 
 
107 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.38 
 
 
118 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.95 
 
 
120 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
106 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.54 
 
 
127 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.6 
 
 
120 aa  100  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  42.99 
 
 
107 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  48.11 
 
 
119 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  47.32 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.11 
 
 
123 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.85 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.79 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
110 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.9 
 
 
124 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.17 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
110 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.11 
 
 
121 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  42.24 
 
 
206 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.23 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.54 
 
 
117 aa  97.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  46.43 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  51.46 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3155  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  46.43 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  46.43 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  46.43 
 
 
130 aa  97.1  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  46.43 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  46.43 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  46.43 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  46.43 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  49.06 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  42.31 
 
 
109 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.67 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.67 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.54 
 
 
117 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1362  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
139 aa  95.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.11 
 
 
116 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  41.35 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  49.06 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  48.54 
 
 
113 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.66 
 
 
116 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.05 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  45.54 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  51.69 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.72 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  42.31 
 
 
110 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  41.75 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.51 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.8 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.76 
 
 
122 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.52 
 
 
132 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  38.94 
 
 
124 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.57 
 
 
116 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.52 
 
 
132 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.18 
 
 
116 aa  93.6  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.52 
 
 
132 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0066  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
110 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.11 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.42 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.74 
 
 
206 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>