More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2181 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
122 aa  244  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  63.55 
 
 
111 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.77 
 
 
110 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0155  HesB/YadR/YfhF  65.48 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.38 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
108 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.55 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.5 
 
 
128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
108 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
108 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
110 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.51 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.79 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  47.71 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.51 
 
 
102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  47.71 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 
118 aa  108  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  43.1 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.22 
 
 
116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.62 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.22 
 
 
116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  47.79 
 
 
110 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  42.48 
 
 
113 aa  107  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.37 
 
 
109 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.75 
 
 
116 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 
114 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
110 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.96 
 
 
116 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
130 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  46.15 
 
 
116 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
116 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  49.07 
 
 
110 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  45.28 
 
 
113 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
117 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  46.23 
 
 
116 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
116 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.02 
 
 
123 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
118 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.34 
 
 
116 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.35 
 
 
116 aa  102  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  49.07 
 
 
110 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  48.15 
 
 
110 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
109 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.48 
 
 
116 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0036  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.34 
 
 
126 aa  102  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.67 
 
 
116 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
124 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0044  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.34 
 
 
126 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.709192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
123 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.34 
 
 
122 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
132 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2976  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.61 
 
 
116 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  41.51 
 
 
130 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.83 
 
 
115 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
118 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
121 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.95 
 
 
109 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.83 
 
 
115 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.57 
 
 
121 aa  100  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1567  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.04 
 
 
125 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.679568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
121 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.23 
 
 
123 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
109 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  39.82 
 
 
121 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1304  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.4 
 
 
108 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
110 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.86 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.23 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.61 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.61 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.61 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1017  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.24 
 
 
116 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1095  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.11 
 
 
120 aa  98.6  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00345667  decreased coverage  0.0031611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
114 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
114 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.18 
 
 
128 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  44.34 
 
 
117 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
114 aa  99  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1203  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.68 
 
 
122 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.592429  hitchhiker  0.0000206592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.11 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
107 aa  98.2  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>