More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0979 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  94.34 
 
 		 106 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  88.68 
 
 		 106 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  81.13 
 
 		 106 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0483  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.15 
 
 		 107 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.26 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0213074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.55 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.38 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  57.14 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  59.05 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0532  hypothetical protein  57.14 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0361463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2184  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 		 106 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3622  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.1 
 
 		 106 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.246464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2271  HesB/YadR/YfhF  53.33 
 
 		 110 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.563165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1255  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 		 106 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1560  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3589  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3939  HesB/YadR/YfhF  49.07 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0482  HesB/YadR/YfhF  46.73 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.239223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4803  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.23 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4257  HesB/YadR/YfhF  45.37 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.52 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 		 133 aa  100  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3630  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3562  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3478  HesB/YadR/YfhF  44.76 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 		 206 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  45.19 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  47.12 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1795  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.06 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0639  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.248132  normal  0.354977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1823  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.06 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1343  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.18 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.388172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.04 
 
 		 119 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4144  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.16 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0915367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  43.81 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  43.81 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  43.81 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  43.81 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2191  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.757462  normal  0.0205433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  43.81 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  43.81 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  43.81 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  43.81 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  46.15 
 
 		 119 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  43.81 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 		 120 aa  94  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  42.31 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0827  HesB family protein  44.23 
 
 		 113 aa  93.6  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0389955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.95 
 
 		 130 aa  93.2  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0629  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  43.81 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0620  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.28 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0594  HesB/YadR/YfhF  43.27 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  42.72 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  41.35 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  44.23 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 		 118 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  55.56 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.95 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3357  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.86 
 
 		 114 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  42.31 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3313  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3302  HesB/YadR/YfhF  45.19 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1513  HesB/YadR/YfhF  40.95 
 
 		 107 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.18 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1530  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.15 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.35 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.12 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.25 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1463  FeS assembly scaffold SufA  42.31 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3064  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  44.23 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  44.34 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>