26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0897 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  100 
 
 
241 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  62.35 
 
 
227 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  31.62 
 
 
248 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  25.85 
 
 
206 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30.34 
 
 
259 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  29.13 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  29.89 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  27.43 
 
 
2449 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  33.33 
 
 
245 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  27.46 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  30.34 
 
 
277 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  31.17 
 
 
112 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.48 
 
 
2179 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  28.45 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  36.67 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  26.39 
 
 
934 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  26.78 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  29.47 
 
 
565 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  35.9 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  35.9 
 
 
170 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.82 
 
 
2272 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  24.47 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.26 
 
 
1888 aa  42.4  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  23.95 
 
 
228 aa  42  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  32.95 
 
 
342 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  25 
 
 
287 aa  42  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>