45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0220 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0220  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7103  PepSY-associated TM helix domain protein  93.33 
 
 		 240 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2345  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  70.71 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.0903937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6407  hypothetical protein  64.2 
 
 		 244 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3576  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  71.43 
 
 		 233 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.548586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5003  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.29 
 
 		 239 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.862813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4358  hypothetical protein  63.82 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3055  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.79 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4478  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.71 
 
 		 239 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0228  hypothetical protein  61.95 
 
 		 239 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.165958  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3394  hypothetical protein  61.95 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0240  hypothetical protein  61.95 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2136  hypothetical protein  61.95 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2952  hypothetical protein  61.95 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.442146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2969  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.56 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.137689  normal  0.135359 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3287  hypothetical protein  61.5 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0422  PepSY-associated TM helix family protein  61.5 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3103  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  66.67 
 
 		 231 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0206  PepSY-associated TM helix family protein  60.62 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3058  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.11 
 
 		 244 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3077  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  63.11 
 
 		 244 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2444  PepSY-associated TM helix  68.53 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2998  PepSY-associated TM helix domain protein  42.04 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3345  PepSY-associated TM helix domain protein  41.15 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3067  hypothetical protein  39.84 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.387636 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2392  PepSY-associated TM helix  39.51 
 
 		 258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.932712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0088  hypothetical protein  77.78 
 
 		 54 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2661  hypothetical protein  27.23 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.522386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5215  PepSY-associated TM helix  29.06 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3029  hypothetical protein  26.56 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178112  hitchhiker  0.000157336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3633  PepSY-associated TM helix  27.57 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5057  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.93 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0118  membrane protein  24.86 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1855  hypothetical protein  23.35 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0378502  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2813  PepSY-associated TM helix  26.36 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1076  PepSY-associated TM helix domain protein  26.7 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000841  hypothetical protein  27.96 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3730  hypothetical protein  25.69 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.301466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12400  PepSY-associated TM helix  26.67 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0430  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.62 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181107  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5640  hypothetical protein  26 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1710  hypothetical protein  25.74 
 
 		 216 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.860634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1500  PepSY-associated TM helix domain protein  23.44 
 
 		 212 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>