More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3419 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  86.12 
 
 
437 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  87.35 
 
 
439 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  84.63 
 
 
436 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  86.12 
 
 
437 aa  678    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  88.29 
 
 
438 aa  731    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  85.95 
 
 
489 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  84.4 
 
 
436 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  86.12 
 
 
437 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  86.36 
 
 
437 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  85.65 
 
 
506 aa  678    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  88.02 
 
 
435 aa  731    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
435 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  97.93 
 
 
435 aa  817    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  84.69 
 
 
483 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  83.52 
 
 
437 aa  706    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  83.52 
 
 
437 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  86.6 
 
 
437 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  87.36 
 
 
438 aa  732    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  84.4 
 
 
436 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  86.12 
 
 
523 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  85.55 
 
 
436 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  74.88 
 
 
438 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  75.82 
 
 
432 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  74.54 
 
 
433 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  75.35 
 
 
432 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  75.12 
 
 
433 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  72.02 
 
 
456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  76.08 
 
 
437 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  72.15 
 
 
438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  76.08 
 
 
437 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  62.17 
 
 
420 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  62.17 
 
 
420 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  62.17 
 
 
420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  58.53 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  59.49 
 
 
442 aa  457  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.68 
 
 
447 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.32 
 
 
441 aa  418  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  52.02 
 
 
463 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  52.02 
 
 
463 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  52.02 
 
 
463 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.78 
 
 
442 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.79 
 
 
441 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 
839 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  52.4 
 
 
440 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.44 
 
 
444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  56.46 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  54.06 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  54.63 
 
 
463 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  50.11 
 
 
452 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  48.39 
 
 
470 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  52.31 
 
 
437 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  47.36 
 
 
482 aa  391  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  47.11 
 
 
470 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  49.55 
 
 
452 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  51.18 
 
 
425 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  53.66 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.66 
 
 
440 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  53.48 
 
 
426 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.61 
 
 
440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.66 
 
 
440 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  53.66 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  53.17 
 
 
412 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.61 
 
 
440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  54.61 
 
 
440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  54.61 
 
 
440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  47.78 
 
 
628 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  49.66 
 
 
466 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  52.13 
 
 
426 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.66 
 
 
440 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.66 
 
 
440 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.66 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.9 
 
 
440 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.66 
 
 
440 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.61 
 
 
440 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.28 
 
 
436 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 
433 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  48.36 
 
 
428 aa  365  1e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  48.27 
 
 
434 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  47.39 
 
 
425 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  48.2 
 
 
472 aa  360  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  52.09 
 
 
423 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  48.06 
 
 
431 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  44.99 
 
 
436 aa  351  1e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  46.77 
 
 
440 aa  350  4e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  46.38 
 
 
445 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  48.92 
 
 
393 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  41.52 
 
 
465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  41.34 
 
 
456 aa  319  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41.65 
 
 
450 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  44.5 
 
 
441 aa  309  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  40.57 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  40.57 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  40.57 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  40.09 
 
 
446 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  39.62 
 
 
439 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  44.75 
 
 
441 aa  302  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  40.09 
 
 
439 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  39.62 
 
 
439 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
440 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 
442 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>