44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1773 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1773  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0989  hypothetical protein  32.14 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1356  hypothetical protein  35.76 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1501  hypothetical protein  39.62 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000010842  normal  0.0102039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0266  hypothetical protein  30.19 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0089  hypothetical protein  35.04 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2181  hypothetical protein  37.62 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.498275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1941  hypothetical protein  28.91 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.86805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1242  hypothetical protein  35.88 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3414  Histone methylation DOT1 family protein  29.87 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1037  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0627  hypothetical protein  27.36 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.717835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4661  putative RNA methylase  28.78 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0852329  normal  0.0763822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1909  hypothetical protein  24.82 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3353  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 251 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0271975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 306 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.490021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1622  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  27.27 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.216797  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1172  hypothetical protein  31.53 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1971  hypothetical protein  30.63 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0975  hypothetical protein  31.58 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.753876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4680  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 260 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 355 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3012  Histone methylation DOT1 family protein  30.17 
 
 		 207 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3910  hypothetical protein  28.95 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0689  hypothetical protein  35.16 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00351729 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0860  hypothetical protein  32.17 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.880222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1498  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  28.07 
 
 		 265 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1705  putative RNA methylase  30.66 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4441  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 294 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0262  hypothetical protein  30.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  normal  0.0219963 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1307  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 		 394 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1002  methyltransferase type 12  29.37 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1609  putative RNA methylase  32.46 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0178031  normal  0.513301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 268 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1123  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.81 
 
 		 394 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0181843  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  42 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1951  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 357 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.066154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2871  flagellar motor protein  27.52 
 
 		 297 aa  41.6  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37393  predicted protein  28.7 
 
 		 228 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.392699  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35472  predicted protein  28.7 
 
 		 228 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0054  methyltransferase type 12  28.7 
 
 		 247 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 234 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  42 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>