131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1297 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1297  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2838  Aldose 1-epimerase  88.89 
 
 
323 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0834033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0900  aldose 1-epimerase  69.51 
 
 
305 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870744 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2751  aldose 1-epimerase  63.4 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1300  aldose 1-epimerase  66.01 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372594  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1712  aldose 1-epimerase  63.73 
 
 
371 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0837  aldose 1-epimerase  65.69 
 
 
303 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0568659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1203  aldose 1-epimerase  65.36 
 
 
320 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1318  aldose 1-epimerase  65.69 
 
 
303 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1512  aldose 1-epimerase  63.73 
 
 
302 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1543  aldose 1-epimerase family protein  63.73 
 
 
302 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169393  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4461  aldose 1-epimerase  65.03 
 
 
303 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.259661  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1989  aldose 1-epimerase  66.01 
 
 
304 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1229  aldose 1-epimerase  65.25 
 
 
303 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0761  aldose 1-epimerase  52.19 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2702  aldose 1-epimerase  50.84 
 
 
301 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1637  Aldose 1-epimerase  47.52 
 
 
312 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12181  normal  0.595367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1965  Aldose 1-epimerase  48 
 
 
312 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.073838  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1585  hypothetical protein  48.45 
 
 
312 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1661  aldose 1-epimerase  33.77 
 
 
306 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  30.42 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0739  Aldose 1-epimerase  28.97 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220443  normal  0.0861855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  26.6 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  26.1 
 
 
289 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  26.42 
 
 
290 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  26.42 
 
 
290 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0156  hypothetical protein  28.92 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.42374  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  26.85 
 
 
286 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  25.56 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  25.56 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0186  hypothetical protein  26.8 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17901  galactose mutarotase-like protein  29.52 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.41246  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25911  galactose mutarotase  27.55 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18071  galactose mutarotase  28.92 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1690  hypothetical protein  28.22 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.400821  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1895  aldose 1-epimerase family protein  26.63 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1472  Aldose 1-epimerase  28.01 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17201  galactose mutarotase-related enzyme  23.88 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.593751  normal  0.935497 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17851  galactose mutarotase-like protein  20.92 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.705452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  30.09 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  29.78 
 
 
292 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  24.43 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  32.38 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  25.64 
 
 
290 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0173  galactose mutarotase-like protein  25.83 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630537  hitchhiker  0.00000000000000230696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  25.19 
 
 
290 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1470  lacX protein  24.05 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0477051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  23.66 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1508  lacX protein  24.05 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0450353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  24.05 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1624  lacX protein  24.05 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1692  putative lacX protein  24.05 
 
 
290 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  27.8 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  24.05 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  34.09 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  24.52 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  26.19 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0295  aldose 1-epimerase family protein  25.75 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0766  Aldose 1-epimerase  25.56 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2366  aldose 1-epimerase  25.78 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.1034  normal  0.210411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5592  Aldose 1-epimerase  26.69 
 
 
288 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0926233  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1127  aldose 1-epimerase  25.51 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0176464  normal  0.584187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1974  Aldose 1-epimerase  24.9 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  26.52 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1357  Aldose 1-epimerase  21.51 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  29.96 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2069  aldose 1-epimerase  33.12 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.290697  normal  0.0540863 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1862  Aldose 1-epimerase  29.29 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563692  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  24.23 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1852  aldose 1-epimerase  29.29 
 
 
294 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0364017  hitchhiker  0.000100246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1865  aldose 1-epimerase family protein  29.29 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00263022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2004  aldose 1-epimerase family protein  29.29 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0921  galactose mutarotase-like protein  24.6 
 
 
295 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0180582  hitchhiker  0.00667173 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6486  Aldose 1-epimerase  27.82 
 
 
288 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  24.7 
 
 
345 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3438  aldose 1-epimerase  22.26 
 
 
284 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01749  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.147084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01737  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2028  aldose 1-epimerase family protein  29.29 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0695948  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2076  aldose 1-epimerase  23.2 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0270  galactose mutarotase related enzyme  25 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1174  Aldose 1-epimerase  25.97 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1383  aldose 1-epimerase  31.75 
 
 
294 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.548696  normal  0.323946 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1400  aldose 1-epimerase  31.75 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757591 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1416  aldose 1-epimerase  31.75 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.270014  normal  0.740212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1886  aldose 1-epimerase  31.75 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00539561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2067  aldose 1-epimerase  31.75 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3627  epimerase family protein  29.14 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586938  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0279  putative aldose 1-epimerase  24.89 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0780  aldose 1-epimerase  24.92 
 
 
292 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000154006  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1964  Aldose 1-epimerase  30 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3737  LacX-related protein  25 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1411  aldose 1-epimerase family protein  28.57 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  29.63 
 
 
290 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  29.47 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2260  Aldose 1-epimerase  33.33 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03050  hypothetical protein  22.68 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5996  Aldose 1-epimerase  27.05 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4230  aldose-1-epimerase family protein  27.32 
 
 
280 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>