43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5514 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5514  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  774    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5044  ParB family protein  40.39 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00200094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4284  parB-like partition proteins  33.45 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6251  parB-like partition protein  29 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0469124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4247  parB-like partition proteins  29.09 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.241941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6874  parB-like partition proteins  29.41 
 
 		 290 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3290  ParB family protein  27.49 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.015441  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5081  parB-like partition protein  27.21 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2115  parB family protein  27.49 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00350884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2410  parB family protein  27.49 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.382726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3177  ParB family protein  27.49 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1423  parB family protein  27.49 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00273947  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1144  parB family protein  27.49 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000253474  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1504  parB family protein  27.49 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00121219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2372  parB family protein  27.05 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0244608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5820  plasmid partition protein  29.61 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6161  parB-like partition protein  26.96 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4152  parB-like partition protein  25.77 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6671  parB-like partition protein  27.57 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.612452 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3161  parB-like partition protein  25.61 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0319824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6194  parB-like partition proteins  28.15 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.221431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5827  parB-like partition proteins  28.15 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3107  parB-like partition protein  25.52 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33324  normal  0.297937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4542  parB-like partition protein  24.63 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0082945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7738  ParB family protein  28.1 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5165  parB-like partition proteins  25.52 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276912  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5694  parB-like partition proteins  25.52 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0238876  hitchhiker  0.0013733 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4966  parB-like partition proteins  25.52 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00677136  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5344  ParB family protein  27.35 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7010  parB-like partition protein  26.44 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.471525  hitchhiker  0.00731349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3027  ParB family protein  26.04 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6001  parB-like partition proteins  27.55 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5757  parB-like partition protein  27.55 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0004  putative partitioning protein  26.81 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00180534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0004  ParB family protein  24.83 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5174  parB-like partition protein  24.67 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1509  parB-like partition protein  24.67 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240811  normal  0.318219 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3897  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3784  parB-like partition protein  26.92 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  25.32 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4471  parB-like partition proteins  33.06 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000480201  decreased coverage  1.87892e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23530  parB-like partition protein  27.23 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  26.27 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>