34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1773 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1773  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1376  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  61.54 
 
 		 169 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2484  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  61.54 
 
 		 169 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.01974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2338  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  64.5 
 
 		 169 aa  190  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1608  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  55.03 
 
 		 169 aa  182  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0524  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  51.16 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1412  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  51.35 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.210554  normal  0.0626613 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1778  hypothetical protein  37.42 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.0573301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3545  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  34.13 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.940799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2076  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  36.42 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.380977  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1036  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  33.54 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.965838  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0357  hypothetical protein  31.46 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0895709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3298  hypothetical protein  38.04 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1875  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  32.65 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00459438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1025  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.85 
 
 		 185 aa  62  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.045195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0558  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.87 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4929  putative TRAP-type C4-dicarboxylate transport system, small permease component  34.55 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.371415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3097  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.75 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.739132  normal  0.502747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3452  TRAP-T family transporter small inner membrane subunit  26.75 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159409  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3714  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25.42 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00000556878  n/a   
 
 
 
NC_009952  Dshi_3154  TRAP transporter-DctQ subunit putative  29.22 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1734  hypothetical protein  26.73 
 
 		 210 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.2002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0606  hypothetical protein  30.82 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0661  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.77 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0643  hypothetical protein  25.5 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0648569 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3428  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  25 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2138  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  23.28 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000455407  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2450  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  26.32 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.561337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4620  hypothetical protein  25.66 
 
 		 199 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1383  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  30.84 
 
 		 241 aa  41.2  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0125297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3569  hypothetical protein  26.17 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1781  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  24.34 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000929504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2568  TRAP transporter, transmembrane protein, putative  27.12 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.667948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0446  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  26.05 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000156898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>