154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0246 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  284  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  82.98 
 
 		 142 aa  220  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  80.85 
 
 		 142 aa  214  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  77.3 
 
 		 142 aa  204  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  75.18 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  78.87 
 
 		 142 aa  200  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  75.89 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  75.89 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  71.83 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  66.2 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  68.31 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  64.79 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  64.79 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  67.38 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  67.61 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  62.41 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  61.97 
 
 		 140 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  62.41 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0381  hypothetical protein  70 
 
 		 131 aa  156  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.314635  normal  0.174306 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  59.29 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  57.75 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  57.75 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  60.28 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  60.28 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  60.28 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  60.99 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  60.28 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  60.99 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  60.28 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  59.57 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  60.28 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  56.03 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  56.34 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  53.19 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  58.74 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  51.75 
 
 		 141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  52.45 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  51.41 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  50.34 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  49.3 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  51.05 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  51.05 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  47.89 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  47.52 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  43.97 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  55.24 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  48.59 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  45.39 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  47.18 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  52.45 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  52.45 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  51.41 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  45.39 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  44.68 
 
 		 144 aa  103  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  43.57 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  37.24 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  41.38 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  41.13 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  37.24 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  37.24 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  38.03 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  39.72 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  39.16 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  40.14 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  37.14 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  44.37 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  43.66 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  43.66 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  36.17 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  38.19 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  41.27 
 
 		 172 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  39.16 
 
 		 177 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  43.26 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  43.06 
 
 		 178 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  39.31 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  36.81 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01813  hypothetical protein  39.58 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0118637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  39.31 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  35.17 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  35.66 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  38.03 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1325  hypothetical protein  41.73 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0175884  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  38.62 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  34.75 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  35.61 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  36.49 
 
 		 195 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  38.57 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  35.61 
 
 		 190 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>