More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5002 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5002  Magnesium chelatase  100 
 
 
358 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.0000241174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1645  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  87.47 
 
 
357 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000343633  normal  0.0310882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3151  magnesium chelatase  76.14 
 
 
342 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1178  magnesium chelatase, ChlI subunit  68.18 
 
 
358 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1658  magnesium chelatase  68.18 
 
 
358 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1577  magnesium chelatase  68.93 
 
 
360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal  0.343579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4807  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  67.6 
 
 
358 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1632  magnesium chelatase  68.47 
 
 
358 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0600916 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1558  magnesium chelatase  67.42 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1581  magnesium chelatase  67.71 
 
 
360 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.106339 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0885  magnesium chelatase, subunit ChII  62.13 
 
 
427 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2101  magnesium chelatase, subunit ChII  61.61 
 
 
427 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1613  magnesium chelatase, subunit ChII  62.13 
 
 
427 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109459  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0275  putative magnesium-chelatase subunit  62.13 
 
 
427 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2406  magnesium-chelatase subunit D/I family protein  60.19 
 
 
416 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1940  magnesium chelatase, subunit ChII  61.61 
 
 
427 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1956  magnesium chelatase, subunit ChII  61.61 
 
 
445 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2423  magnesium chelatase  61.37 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.536796  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3506  magnesium chelatase  61.73 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0248743  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2270  magnesium chelatase  61.73 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2772  magnesium chelatase  54.22 
 
 
333 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.99 
 
 
335 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3097  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.02 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3014  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.7 
 
 
344 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.397275  normal  0.647492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5745  magnesium chelatase  55.34 
 
 
386 aa  298  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475709 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3380  magnesium chelatase  54.23 
 
 
594 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.193165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  51.45 
 
 
342 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.31 
 
 
688 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  58.33 
 
 
337 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  59.27 
 
 
336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.64 
 
 
362 aa  285  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.27 
 
 
364 aa  285  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  48.34 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  48.16 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  46.97 
 
 
374 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.83 
 
 
362 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.24 
 
 
405 aa  281  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.81 
 
 
373 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.53 
 
 
362 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.77 
 
 
369 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  42.82 
 
 
614 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  47.73 
 
 
362 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  46.22 
 
 
362 aa  276  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  53.24 
 
 
626 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.7 
 
 
357 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.7 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  45.7 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  45.58 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.62 
 
 
362 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.62 
 
 
362 aa  272  6e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  45.62 
 
 
362 aa  271  9e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2071  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.71 
 
 
622 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.71 
 
 
622 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0165109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  53.71 
 
 
622 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  45.35 
 
 
364 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.22 
 
 
616 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  45.71 
 
 
397 aa  268  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  46.52 
 
 
637 aa  268  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  45.82 
 
 
364 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  48.64 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  43.73 
 
 
345 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2302  magnesium chelatase  51.66 
 
 
638 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  49.24 
 
 
336 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  45.54 
 
 
365 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.96 
 
 
665 aa  262  4.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  43.43 
 
 
351 aa  262  6e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  42.3 
 
 
680 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  47.84 
 
 
314 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  49.06 
 
 
660 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  43.45 
 
 
309 aa  257  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.69 
 
 
337 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1020  cobaltochelatase subunit  41.27 
 
 
653 aa  257  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.816011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.87 
 
 
674 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.69 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  47.63 
 
 
337 aa  256  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.27 
 
 
384 aa  256  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.89 
 
 
382 aa  256  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.96 
 
 
383 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  48.57 
 
 
696 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  48.43 
 
 
670 aa  255  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12865  magnesium chelatase  53.74 
 
 
629 aa  255  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498334  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.52 
 
 
788 aa  255  8e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  44.27 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  44.27 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  41.05 
 
 
443 aa  253  3e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  42.64 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  43.65 
 
 
383 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1277  Magnesium chelatase  48.75 
 
 
650 aa  253  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.951784  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  46.01 
 
 
689 aa  252  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  41.93 
 
 
337 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2134  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.23 
 
 
674 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.118601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  44.38 
 
 
337 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.88 
 
 
340 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  42.55 
 
 
346 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  45.1 
 
 
334 aa  248  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  54.26 
 
 
618 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.84 
 
 
368 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.18 
 
 
341 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  46.25 
 
 
340 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  38.44 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>