106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4379 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  68 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  63.49 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  63.49 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  63.49 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  61.9 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2455  PilT domain-containing protein  56.8 
 
 		 125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  47.2 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1572  PilT protein domain protein  49.6 
 
 		 125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  48.84 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3503  hypothetical protein  48 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000000742258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  47.93 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0576  hypothetical protein  47.15 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0413  PIN domain protein  47.15 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.688316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  47.29 
 
 		 133 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3715  PilT domain-containing protein  47.24 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0601342 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0198  PilT protein domain protein  48.44 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.398764  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  48.82 
 
 		 128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  46.28 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1573  PIN domain protein  42.97 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  50.4 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4034  PilT protein-like  45.53 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.507909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  50.42 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  44.63 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0993  PilT protein-like  44.63 
 
 		 128 aa  100  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4018  hypothetical protein  41.22 
 
 		 131 aa  100  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  46.03 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4056  PilT domain-containing protein  46.28 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0628  PilT domain-containing protein  43.65 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4123  PilT protein domain protein  46.22 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.454937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0706  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.816914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4539  PilT protein domain protein  44.63 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4573  PilT protein domain protein  45.97 
 
 		 136 aa  97.1  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3824  PilT protein-like  45.45 
 
 		 129 aa  96.7  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2442  PilT domain-containing protein  43.2 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0388394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0064  PilT domain-containing protein  42.98 
 
 		 128 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2387  PilT protein domain protein  41.18 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2422  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3367  PilT protein domain protein  47.58 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.014061 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0277  hypothetical protein  36.43 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0011733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0025  PilT protein-like  42.15 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0045  PilT domain-containing protein  42.15 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  39.34 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  40.68 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0697  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.105307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2648  PilT domain-containing protein  44.63 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0721441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1428  PilT protein domain protein  43.44 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1434  PilT protein-like  43.8 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.536835  normal  0.658173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3632  PilT protein domain protein  43.44 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4956  PilT protein domain protein  42.75 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1995  PilT domain-containing protein  43.9 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.691704  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  39.84 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2598  PilT domain-containing protein  40.8 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0709656  normal  0.0156021 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6684  PilT protein domain protein  42.31 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185489  normal  0.593771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  36.67 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0280  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0767  PilT protein-like  36.07 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.351411  normal  0.156815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2680  PilT protein domain protein  36.72 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4004  PilT protein domain protein  37.7 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000733921  hitchhiker  0.00000000266973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2529  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2346  PilT protein domain protein  43.64 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2712  PilT protein domain protein  42.4 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0205  PilT protein domain protein  43.44 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.696325  normal  0.132115 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4043  PilT protein-like  38.21 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.280073  normal  0.218169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1939  PilT protein domain protein  36.59 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2940  PilT domain-containing protein  37.29 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.085873  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3651  PilT protein domain protein  38.71 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2224  PilT protein domain protein  42.28 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4694  PilT domain-containing protein  40.2 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.499917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3678  hypothetical protein  43.62 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.36052  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1187  PilT protein domain protein  37.29 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0967234  normal  0.700283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0669  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6309  hypothetical protein  38.05 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0688  PilT protein domain protein  34.15 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00227105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0109  hypothetical protein  34.96 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1598  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  35.48 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  41.38 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2995  PilT protein domain protein  38.14 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565666  normal  0.167497 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5379  hypothetical protein  57.41 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  36.59 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3327  PilT protein domain protein  37.17 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0118  PilT protein-like protein  29.84 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2734  PilT protein domain protein  36.75 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0608  PilT protein domain protein  34.96 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.332384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3328  PilT protein domain protein  37.39 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4312  PilT protein-like  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693301  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4553  PilT protein-like  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0286007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1292  hypothetical protein  27.64 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  34.13 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1068  PilT protein domain protein  32.79 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  32.81 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  34.13 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0115  hypothetical protein  52.83 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2183  hypothetical protein  42.37 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.765275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1457  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.739604  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  28.03 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>