97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5995 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5995  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  200  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532298  normal  0.410232 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  81.82 
 
 
99 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  81.82 
 
 
99 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  78.79 
 
 
99 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1838  putative sarcosine oxidase alpha subunit  53 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0205  hypothetical protein  50.56 
 
 
108 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  51.02 
 
 
103 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  50.55 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8314  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  58.82 
 
 
98 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4415  hypothetical protein  48.89 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.706002  normal  0.855895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  49.46 
 
 
99 aa  84.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6004  hypothetical protein  56.82 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586862  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4342  putative sarcosine oxidase alpha subunit  48.1 
 
 
98 aa  80.1  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  0.580736 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  41.57 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  51.81 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7054  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1892  hypothetical protein  54.12 
 
 
126 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00275007  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2707  hypothetical protein  58.11 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.861787  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2710  hypothetical protein  61.67 
 
 
97 aa  74.7  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.678347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4375  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6534  hypothetical protein  46.91 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.855278 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4935  hypothetical protein  53.62 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254281  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  46.84 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  49.35 
 
 
87 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2741  putative sarcosine oxidase alpha subunit  53.42 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00423187  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  43.68 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  46.15 
 
 
95 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  41.67 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.53 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  40 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  42.22 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  42.5 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  36.71 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
983 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  43.06 
 
 
469 aa  60.5  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.36 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  36.36 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.86 
 
 
429 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.88 
 
 
478 aa  59.7  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.77 
 
 
452 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  35.44 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  45.21 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  51.67 
 
 
960 aa  57.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  36 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  36 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  36 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.56 
 
 
429 aa  57  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.56 
 
 
429 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  35.06 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  49.02 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
452 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.03 
 
 
591 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 
984 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  41.89 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3638  hypothetical protein  37.33 
 
 
115 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0468705  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0690  hypothetical protein  36.14 
 
 
107 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0780442  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2138  hydrogenase, Fe-only  35.16 
 
 
581 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000865974  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6614  hypothetical protein  38.46 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0572685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  41.1 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6381  hypothetical protein  38.46 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5373  hypothetical protein  35.37 
 
 
114 aa  47.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  34.18 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3538  hypothetical protein  34.15 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.227842  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2941  hypothetical protein  37.18 
 
 
102 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5061  hypothetical protein  34.12 
 
 
115 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.29675 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3632  hypothetical protein  32.93 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.315693 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6212  hypothetical protein  42.62 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.56865  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4428  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121041  normal  0.609909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4731  hypothetical protein  32.93 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428558  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  46.58 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3103  hydrogen cyanide synthase HcnA  43.24 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0827146  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.84 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1499  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  31.71 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335982  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6086  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  31.71 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.825562 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.84 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.84 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  31.17 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  43.84 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0886  hypothetical protein  36.14 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  42.47 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  42.47 
 
 
77 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4224  ferredoxin  43.84 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36330  hydrogen cyanide synthase HcnA  41.89 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.533947 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6587  putative NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  32.53 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29085 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4142  ferredoxin  43.84 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.390351  normal  0.0464627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.09 
 
 
967 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3944  hypothetical protein  31.71 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260668  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6627  hypothetical protein  37.78 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511531  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1892  ferredoxin  45.21 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  32.63 
 
 
957 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3377  ferredoxin  43.84 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264604  normal  0.288176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 
911 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0755  hypothetical protein  36.96 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2521  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.980113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1155  NADH-quinone oxidoreductase, chain G  46.34 
 
 
823 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 
953 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>