49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2796 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2796  plasmid stability protein  100 
 
 
94 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.485271  normal  0.185476 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6536  putative plasmid stability protein  51.19 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0896762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1881  plasmid stability protein  43.59 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0760602 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3181  hypothetical protein  42.17 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1046  hypothetical protein  41.56 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0839246  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4150  hypothetical protein  41.18 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4027  Resolvase domain protein  44.19 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3576  hypothetical protein  44 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00242199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23560  hypothetical protein  46.58 
 
 
81 aa  53.9  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.459233  normal  0.445155 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3696  hypothetical protein  41.56 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2641  hypothetical protein  50.94 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1361  plasmid stability protein, putative  38.55 
 
 
97 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4020  hypothetical protein  38.89 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1069  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0687  hypothetical protein  34.57 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.153428  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0629  hypothetical protein  34.72 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1877  hypothetical protein  36.14 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.453683  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4618  hypothetical protein  32.05 
 
 
87 aa  47.4  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0043  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  61.54 
 
 
479 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.658054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1593  hypothetical protein  56.1 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.714896  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3514  hypothetical protein  60.98 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264165  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4588  hypothetical protein  60.98 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3454  plasmid stabilization protein  46.38 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0622  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  57.5 
 
 
485 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0209  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  59.46 
 
 
485 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0380  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  56.41 
 
 
475 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1709  hypothetical protein  41.18 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358653  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5670  plasmid stability protein-like protein  44.83 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0826  hypothetical protein  39.66 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.448113  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1427  hypothetical protein  46.3 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4335  plasmid stability protein StbC  41.38 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0791  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.699081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0084  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  52.5 
 
 
481 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3903  hypothetical protein  46.3 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4365  hypothetical protein  46.3 
 
 
78 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1319  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  61.11 
 
 
461 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1455  plasmid stability protein-like protein  44.07 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0948789  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1779  plasmid stability protein, putative  44.07 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1544  panthotenate metabolism flavoprotein  52.5 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5836  hypothetical protein  46.3 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4466  hypothetical protein  46.3 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4211  hypothetical protein  37.33 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176867  normal  0.948533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3902  hypothetical protein  46.3 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.960527  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0051  bifunctional SbtC-like/phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate synthase  53.85 
 
 
479 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0750975  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1965  hypothetical protein  44.74 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.30169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5842  plasmid stability protein StbC  44.26 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2074  putative plasmid stability protein  39.13 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0207391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0726  hypothetical protein  34.72 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3796  Arc domain-containing protein  36.23 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>