More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1880 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
209 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50.5 
 
 
209 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.5 
 
 
215 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  44.71 
 
 
209 aa  171  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1743  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.76 
 
 
215 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565671  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  44.23 
 
 
209 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  47.03 
 
 
206 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.03 
 
 
206 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.53 
 
 
207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  46 
 
 
209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.29 
 
 
207 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.75 
 
 
209 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.46 
 
 
205 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1399  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  48.34 
 
 
217 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.88 
 
 
203 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.59 
 
 
210 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1763  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.88 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.619286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1802  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.12 
 
 
207 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0240208  normal  0.177395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.42 
 
 
204 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.52 
 
 
206 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0955  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.69 
 
 
205 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.42 
 
 
214 aa  131  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.46 
 
 
208 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2518  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.39 
 
 
211 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135192  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.29 
 
 
212 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.92 
 
 
235 aa  124  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2873  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.48 
 
 
213 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.68 
 
 
216 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0693  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.81 
 
 
209 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3099  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.87 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.554479  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  36.14 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.35 
 
 
212 aa  118  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  34.98 
 
 
212 aa  118  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  32.84 
 
 
206 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.48 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.48 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  34.48 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  35.27 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.16 
 
 
213 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  34.98 
 
 
212 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.39 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.85 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.35 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.52 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.15 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0635  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.67 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.586575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.03 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.17 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  33.98 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0268  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.2 
 
 
206 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.37 
 
 
206 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.35 
 
 
198 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.86 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.42 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.666037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.86 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  34.65 
 
 
212 aa  112  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  38.79 
 
 
214 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.88 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  33.16 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0272  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.13 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0527  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.9 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  33.17 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.67 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.73 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.71 
 
 
217 aa  108  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  108  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  33 
 
 
207 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  33.5 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.32 
 
 
213 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 
211 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>