110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1539 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2292  hypothetical protein  40.4 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  34.02 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  34.02 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2766  hypothetical protein  32.99 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.906138  normal  0.115271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  31.91 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  31.25 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1013  hypothetical protein  32.98 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  37.62 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2249  ferredoxin-like protein  35.35 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0215756 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  28.16 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4470  hypothetical protein  30.91 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.295194  normal  0.0572132 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 607 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 607 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  36.46 
 
 		 109 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  35 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  26.26 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  36.78 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0183  ferredoxin-like  33.02 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  32.18 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 		 602 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 		 610 aa  52.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  42.59 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  42.59 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1866  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.56 
 
 		 410 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156211  normal  0.343639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  31.33 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1581  ferredoxin-like protein  32.61 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1606  Ferredoxin-like protein  32.61 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  32.94 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  46.81 
 
 		 120 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2241  hypothetical protein  30.53 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  34.09 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  31 
 
 		 343 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  34.09 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.91 
 
 		 410 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  34.09 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  34.12 
 
 		 105 aa  50.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  30 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  30.93 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  31.96 
 
 		 596 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0856  Ferredoxin-like protein  31.58 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1748  ferredoxin  27.88 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 		 626 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  29.63 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2882  Ferredoxin-like protein  30 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.11 
 
 		 408 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  27.88 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  31.31 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  31.31 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4743  hypothetical protein  32.14 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2739  2Fe-2S ferredoxin  29.47 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  31.31 
 
 		 596 aa  47.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  24.49 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1346  hypothetical protein  29.59 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  31.76 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0688  putative ferredoxin like protein  28.71 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0333  ferredoxin, 2Fe-2S  28.4 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  26.47 
 
 		 572 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2884  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.954473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4568  hypothetical protein  32 
 
 		 241 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  29.76 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  28.74 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  29.07 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  29.13 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  27.88 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  25.25 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  32.18 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  32.18 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1971  putative ferredoxin like protein  38.3 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.384537  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1111  hypothetical protein  31.03 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188451  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  24.49 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  29.89 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0912  ferredoxin-like protein  26.79 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0934  ferredoxin-like protein  26.79 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  28.05 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.3 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  28.09 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  35.29 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  28.41 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  29.27 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2408  ferredoxin-like protein  45.1 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  27.91 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  28.41 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1297  hypothetical protein  26.67 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  27.55 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  31.4 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  28.92 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  28.71 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 		 626 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 		 595 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  29.41 
 
 		 626 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  26.53 
 
 		 624 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  24.21 
 
 		 597 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  32.67 
 
 		 552 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  29.17 
 
 		 102 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3789  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.73 
 
 		 273 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.040957  normal  0.896833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1544  cobalamin biosynthesis protein  29.63 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000172784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  23.96 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  23.66 
 
 		 614 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>