108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1297 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1297  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  255  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0340  ferredoxin  66.39 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000592647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2140  hypothetical protein  58.47 
 
 		 121 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2234  ferredoxin  60.98 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3803  hypothetical protein  56.78 
 
 		 123 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0918  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  48.74 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0098  ferredoxin-like protein  47.9 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000332289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1718  NADH dehydrogenase (quinone)  46.22 
 
 		 619 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.081204  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0912  ferredoxin-like protein  38.98 
 
 		 126 aa  100  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0934  ferredoxin-like protein  38.98 
 
 		 126 aa  100  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0174  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  41.03 
 
 		 119 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0994  ferredoxin-like protein  37.29 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1171  ferredoxin-like protein  36.44 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0148  NADP-reducing hydrogenase chain B  39.29 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  41.74 
 
 		 619 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  40.38 
 
 		 562 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0834  NADH dehydrogenase I, F subunit  36.61 
 
 		 617 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0914  NADH:ubiquinone oxidoreductase, NADH-binding (51 kD) subunit  34.45 
 
 		 571 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1248  NADH dehydrogenase (quinone)  39.33 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.600832  normal  0.0289049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0343  NADH dehydrogenase I, F subunit  36.17 
 
 		 591 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4239  NADH dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 		 593 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3517  NADP-reducing hydrogenase, subunit B  33.04 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0725  NADH dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 		 596 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  34.48 
 
 		 572 aa  62  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1845  NADP-reducing hydrogenase chain B  36.61 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3350  NADH dehydrogenase I, F subunit  32.98 
 
 		 591 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.051471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  38.14 
 
 		 597 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1635  NADP-reducing hydrogenase chain B  33.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000061136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1603  NADP-reducing hydrogenase chain B  33.04 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3133  NADH dehydrogenase (quinone)  35.87 
 
 		 590 aa  57  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.846536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0657  NADH dehydrogenase (quinone)  29.67 
 
 		 590 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0844  NADH dehydrogenase (quinone)  30.97 
 
 		 562 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0257852  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0913  NADH dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 		 607 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0935  NADH dehydrogenase (quinone)  37.93 
 
 		 607 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0554  ferredoxin, 2Fe-2S  42.03 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  35.37 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  29.11 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0157  NADH dehydrogenase (quinone)  38.68 
 
 		 626 aa  53.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2099  NADH dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 		 634 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0860011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0173  NADH dehydrogenase (quinone)  36.47 
 
 		 597 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 		 572 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2713  NADH dehydrogenase (quinone)  31.68 
 
 		 552 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3600  NADH dehydrogenase (quinone)  27.43 
 
 		 614 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  46.03 
 
 		 598 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  35 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  39.24 
 
 		 602 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3830  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  28.33 
 
 		 677 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3291  NADH dehydrogenase (quinone)  30.83 
 
 		 575 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3921  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  31.4 
 
 		 593 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4005  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 		 593 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42089e-25 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  40.26 
 
 		 596 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  37.68 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1450  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.91 
 
 		 636 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101445  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 		 610 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0624  NADH dehydrogenase (quinone)  27.59 
 
 		 614 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000168904  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  30.56 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06320  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 51 kDa subunit  30.53 
 
 		 594 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000903471  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  31.2 
 
 		 626 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  31.2 
 
 		 626 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2804  NADH dehydrogenase (quinone)  33.96 
 
 		 636 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 		 595 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01800  NADH dehydrogenase I subunit F  31.78 
 
 		 624 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.235185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.55 
 
 		 588 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.57 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0472  NADH dehydrogenase (quinone)  30.95 
 
 		 594 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17600  ferredoxin  30.59 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2721  NAD-reducing hydrogenase, alpha subunit  28.28 
 
 		 570 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1485  ferredoxin, 2Fe-2S  36.36 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0205  hypothetical protein  38.03 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247949  normal  0.166868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1031  ferredoxin, 2Fe-2S  38.89 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2936  hypothetical protein  34.78 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  37.65 
 
 		 597 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  31.76 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  30.51 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  34.94 
 
 		 597 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  31.76 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  30.51 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  30.43 
 
 		 343 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  31.76 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1110  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  26 
 
 		 569 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.163971 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_767  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit E subfamily  28.83 
 
 		 641 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1539  hypothetical protein  26.67 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  27.06 
 
 		 596 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  28.77 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  32.52 
 
 		 635 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  35.85 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  33.33 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0491  NADH dehydrogenase (quinone)  31.86 
 
 		 623 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0226  NADH dehydrogenase (quinone)  28.46 
 
 		 632 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.096685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0989  NADH dehydrogenase (quinone)  27.06 
 
 		 516 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2420  2Fe-2S ferredoxin  36 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  33.68 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3691  NADH dehydrogenase (quinone)  36 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.495814  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1489  NADH dehydrogenase (quinone)  24.76 
 
 		 570 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0098  NADH dehydrogenase (quinone)  28.43 
 
 		 535 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  28.43 
 
 		 535 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.693174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1867  ferredoxin, 2Fe-2S, putative  35.71 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  38.36 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  28.81 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>