More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2803 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2803  regulatory protein LacI  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.578503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3936  LacI family transcription regulator  64.94 
 
 
308 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4237  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  61.32 
 
 
287 aa  351  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4128  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  59.58 
 
 
287 aa  348  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.070286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3846  ribose operon repressor  59.58 
 
 
287 aa  348  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4173  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  60.98 
 
 
287 aa  345  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4013  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  59.23 
 
 
287 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4326  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  59.23 
 
 
287 aa  345  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3860  ribose operon repressor  58.89 
 
 
287 aa  342  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4214  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  60.63 
 
 
287 aa  341  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1023  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  58.19 
 
 
287 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.58 
 
 
323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  38.84 
 
 
323 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  38.53 
 
 
323 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  38.53 
 
 
323 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  38.53 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  38.23 
 
 
323 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  38.23 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  38.23 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  37.92 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  37.92 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  37.92 
 
 
323 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 
325 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 
329 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  33.23 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  30.49 
 
 
333 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  30.49 
 
 
333 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  30.49 
 
 
333 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  30.49 
 
 
333 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  30.49 
 
 
333 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  33.22 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 
332 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  28.66 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1712  sucrose operon repressor  30.31 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.772811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 
332 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  29.18 
 
 
328 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 
332 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.36 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  30.86 
 
 
336 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  30.03 
 
 
330 aa  136  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.39 
 
 
341 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.39 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.19 
 
 
346 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.44 
 
 
341 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.61 
 
 
330 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.79 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  30.4 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  29.56 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1803  LacI family transcription regulator  27.47 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00004995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.87 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.7 
 
 
334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.57 
 
 
347 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  26.98 
 
 
351 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.94 
 
 
338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  27.49 
 
 
333 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 
338 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.53 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29.09 
 
 
341 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1692  sucrose operon repressor ScrR  28.48 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  25.68 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0519  LacI family transcription regulator  27.3 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.18 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.18 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.18 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  29.7 
 
 
331 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  29.73 
 
 
340 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  26.05 
 
 
342 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3432  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 
336 aa  125  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000329456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.25 
 
 
336 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  24.77 
 
 
326 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.81 
 
 
333 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1214  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 
333 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  27.89 
 
 
336 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 
348 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  28.92 
 
 
343 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1791  catabolite control protein A  30.42 
 
 
329 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.42313  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1826  catabolite control protein A  30.42 
 
 
329 aa  122  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000092301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  28.79 
 
 
332 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  29 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.3 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  27.98 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  29.38 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  25.61 
 
 
333 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  29.22 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  28.98 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  28.48 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  29.22 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  29.22 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  28.01 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 
340 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  28.88 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.8 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.85 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  29.22 
 
 
343 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 
325 aa  119  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  28.34 
 
 
325 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  28.34 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>