More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK3860 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK3860  ribose operon repressor  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3846  ribose operon repressor  96.52 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4128  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  96.52 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.070286 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4013  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  96.17 
 
 
287 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4326  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  96.17 
 
 
287 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4173  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  89.2 
 
 
287 aa  508  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4237  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  89.9 
 
 
287 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1023  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  82.58 
 
 
287 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4214  putative sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  81.53 
 
 
287 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3936  LacI family transcription regulator  71.78 
 
 
308 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2803  regulatory protein LacI  58.89 
 
 
308 aa  342  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.578503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  35.88 
 
 
323 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  35.88 
 
 
323 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  35.88 
 
 
323 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  36.21 
 
 
323 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  35.88 
 
 
323 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.21 
 
 
323 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  35.88 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  35.55 
 
 
323 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  35.88 
 
 
323 aa  192  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  35.55 
 
 
323 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  35.88 
 
 
323 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  33.01 
 
 
324 aa  142  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  30.94 
 
 
325 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 
334 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  27.83 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.71 
 
 
341 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0837  alanine racemase  31.05 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.12 
 
 
341 aa  113  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  27.18 
 
 
346 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  26.43 
 
 
355 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  27.18 
 
 
347 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.65 
 
 
341 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4188  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.39 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  27 
 
 
326 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  26.77 
 
 
337 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.1 
 
 
331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1640  LacI family transcription regulator  27.42 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 
339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.69 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  27.69 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  27.69 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.13 
 
 
341 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1086  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.39 
 
 
325 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  26.45 
 
 
337 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  27.27 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1712  sucrose operon repressor  28.25 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.772811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.13 
 
 
337 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1803  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 
327 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00004995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 
332 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  27.87 
 
 
332 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1186  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  30.07 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0999  LacI family transcription regulator  30.07 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1002  LacI family transcription regulator  30.07 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1118  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.77 
 
 
342 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.945809  hitchhiker  0.0011577 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1164  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 
337 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1245  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 
337 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.3 
 
 
341 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.78 
 
 
340 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0119  ribose operon repressor RbsR  27.48 
 
 
328 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  27.54 
 
 
332 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  27.04 
 
 
338 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.86 
 
 
331 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.97 
 
 
341 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  27.96 
 
 
333 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.51 
 
 
333 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.97 
 
 
341 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.97 
 
 
341 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  27.96 
 
 
333 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  27.96 
 
 
333 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  27.96 
 
 
333 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  28.71 
 
 
332 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  27.96 
 
 
333 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.6 
 
 
340 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 
333 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  26.91 
 
 
336 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  25.57 
 
 
361 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1780  sucrose operon repressor  29.08 
 
 
330 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000248781 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  27.15 
 
 
331 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  27.12 
 
 
340 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  26.06 
 
 
338 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1003  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 
337 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  27.45 
 
 
340 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  26.37 
 
 
331 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  25.16 
 
 
334 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  27.96 
 
 
334 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  26.3 
 
 
330 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 
325 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.83 
 
 
339 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 
327 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  26.21 
 
 
348 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.8 
 
 
334 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 
332 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1692  sucrose operon repressor ScrR  29.26 
 
 
320 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  27.1 
 
 
331 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  26.82 
 
 
337 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  27.8 
 
 
340 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  27.96 
 
 
325 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.741114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>